110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2149 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2149  rhodanese domain protein  100 
 
 
131 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.262587  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1986  rhodanese domain-containing protein  71.76 
 
 
137 aa  201  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4425  Rhodanese domain protein  68.22 
 
 
129 aa  191  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4402  rhodanese domain-containing protein  65.38 
 
 
141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  57.81 
 
 
136 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0777  rhodanese-like protein  56.49 
 
 
139 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808709  normal  0.0344492 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  55.47 
 
 
144 aa  147  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  58.4 
 
 
136 aa  146  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  55.73 
 
 
139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  55.73 
 
 
139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  57.14 
 
 
134 aa  143  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  53.79 
 
 
146 aa  141  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  56 
 
 
145 aa  140  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  55.56 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2088  hypothetical protein  54.89 
 
 
169 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0947585  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  53.17 
 
 
144 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4349  rhodanese domain-containing protein  59.54 
 
 
139 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000446887 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  50.78 
 
 
166 aa  134  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4865  rhodanese domain-containing protein  59.54 
 
 
139 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22928  hitchhiker  0.000154413 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  58.78 
 
 
141 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5372  rhodanese domain-containing protein  56.49 
 
 
139 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0673577  normal  0.0625322 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0963  rhodanese domain-containing protein  60.47 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144935  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0834  rhodanese-like domain-containing protein  60.47 
 
 
155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2213  rhodanese-like domain-containing protein  60.47 
 
 
155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00171016  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0054  rhodanese-like domain-containing protein  60.47 
 
 
155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0184557  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0871  rhodanese domain-containing protein  60.47 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1566  rhodanese-like domain-containing protein  60.47 
 
 
155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1761  rhodanese-like domain-containing protein  59.69 
 
 
174 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  40.52 
 
 
133 aa  86.7  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  41.82 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  45.05 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0872  rhodanese domain-containing protein  35.65 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03114  hypothetical protein  39.29 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0450436  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  34.82 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  34.82 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  40.2 
 
 
241 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  38.26 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
227 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
224 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
224 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
224 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
224 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
224 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
230 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  30.17 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  30.17 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
224 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
253 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
222 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
231 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  37.65 
 
 
221 aa  51.2  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  31.34 
 
 
221 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  35.56 
 
 
223 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
221 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
221 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  36.56 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  39.19 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.95 
 
 
393 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  29.6 
 
 
218 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 
221 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0588  putative NADH oxidase  31.09 
 
 
567 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  30.09 
 
 
221 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  28.99 
 
 
226 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000099  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.41 
 
 
567 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  34.48 
 
 
247 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  38.36 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  31.51 
 
 
218 aa  44.7  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
233 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
235 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
235 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
235 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0494  hypothetical protein  29.59 
 
 
142 aa  43.5  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  32.29 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  35.06 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
226 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  36.26 
 
 
252 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  36.49 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  37.18 
 
 
553 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
223 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05707  hypothetical protein  30.25 
 
 
567 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  42.31 
 
 
133 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  36.19 
 
 
113 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 
145 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  31.36 
 
 
269 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  27.88 
 
 
174 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  34.41 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
228 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  29.09 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  32.47 
 
 
271 aa  41.2  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
227 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  37.1 
 
 
459 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0088  rhodanese domain-containing protein  32.43 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00487418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4642  Rhodanese domain protein  35 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.845465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>