More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0054 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0834  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 		 155 aa  315  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1566  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 		 155 aa  315  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0054  rhodanese-like domain-containing protein  100 
 
 		 155 aa  315  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0184557  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0871  rhodanese domain-containing protein  99.35 
 
 		 155 aa  313  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0963  rhodanese domain-containing protein  98.71 
 
 		 155 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144935  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2213  rhodanese-like domain-containing protein  98.71 
 
 		 155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00171016  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1761  rhodanese-like domain-containing protein  95.49 
 
 		 174 aa  209  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0777  rhodanese-like protein  78.12 
 
 		 139 aa  209  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808709  normal  0.0344492 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  80.47 
 
 		 139 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  80.47 
 
 		 139 aa  202  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  71.43 
 
 		 144 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  69.17 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5372  rhodanese domain-containing protein  81.4 
 
 		 139 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0673577  normal  0.0625322 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  66.41 
 
 		 146 aa  185  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  80.47 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4865  rhodanese domain-containing protein  79.07 
 
 		 139 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22928  hitchhiker  0.000154413 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4349  rhodanese domain-containing protein  79.07 
 
 		 139 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000446887 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  70.63 
 
 		 134 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2088  hypothetical protein  64.93 
 
 		 169 aa  176  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0947585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  62.9 
 
 		 136 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  62.2 
 
 		 166 aa  164  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  63.85 
 
 		 136 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2149  rhodanese domain protein  60.47 
 
 		 131 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.262587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  59.06 
 
 		 144 aa  156  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1986  rhodanese domain-containing protein  58.91 
 
 		 137 aa  155  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4402  rhodanese domain-containing protein  60.61 
 
 		 141 aa  153  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  59.52 
 
 		 145 aa  153  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4425  Rhodanese domain protein  57.36 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  45.74 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  46.98 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03114  hypothetical protein  37.21 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0450436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0872  rhodanese domain-containing protein  35.04 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  39.09 
 
 		 241 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  36.94 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  38.81 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  39.85 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  33.93 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  33.93 
 
 		 146 aa  67  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  39.08 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  37.93 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  33.67 
 
 		 247 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  32.22 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  36.67 
 
 		 480 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 		 218 aa  57.4  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 224 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  36.14 
 
 		 218 aa  57.4  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 224 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 230 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 224 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 224 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 224 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  35.56 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.94 
 
 		 568 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  36.78 
 
 		 480 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  35.23 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  33.72 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  36.63 
 
 		 232 aa  54.3  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  40.38 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.67 
 
 		 393 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  35.42 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 231 aa  53.5  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0780  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.112392 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  36.56 
 
 		 280 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 233 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  34.78 
 
 		 223 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  27.1 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0237  Rhodanese domain protein  42.65 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 		 221 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  35.37 
 
 		 271 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  36.17 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  32.98 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  40.45 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  34.86 
 
 		 225 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  34.86 
 
 		 225 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 220 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  32.95 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 228 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  34.07 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  37.37 
 
 		 380 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 129 aa  50.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 221 aa  50.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 		 269 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  33.72 
 
 		 220 aa  50.4  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>