112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0504 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 152 aa  319  8e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  88.81 
 
 		 143 aa  278  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0494  hypothetical protein  79.58 
 
 		 142 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0483  rhodanese domain-containing protein  73.83 
 
 		 151 aa  237  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4476  rhodanese domain-containing protein  72.54 
 
 		 142 aa  226  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0480  rhodanese domain-containing protein  70.42 
 
 		 142 aa  220  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  72.73 
 
 		 141 aa  197  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4001  rhodanese domain-containing protein  61.81 
 
 		 146 aa  197  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3363  rhodanese domain-containing protein  59.03 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0480  hypothetical protein  59.03 
 
 		 146 aa  192  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3876  rhodanese domain-containing protein  59.03 
 
 		 147 aa  186  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3541  rhodanese domain-containing protein  64.8 
 
 		 147 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0490  rhodanese domain-containing protein  64.8 
 
 		 147 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0489  rhodanese domain-containing protein  64 
 
 		 147 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  32.39 
 
 		 689 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  31.47 
 
 		 688 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  38.2 
 
 		 363 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  37.68 
 
 		 377 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  31.48 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  32.98 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  30.56 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  32.04 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  41.07 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  29.31 
 
 		 406 aa  51.6  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2303  rhodanese-like protein  40 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.788958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  27.56 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2215  rhodanese-like protein  38.33 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.636017  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  33.77 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  33.66 
 
 		 670 aa  50.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  36.62 
 
 		 432 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  28.43 
 
 		 123 aa  48.5  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  30.69 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2035  rhodanese domain-containing protein  27.72 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685184 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  34.44 
 
 		 454 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  28.17 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  33.77 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  30.43 
 
 		 353 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  29.21 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  33.02 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  34.72 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  30 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  31.96 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  32.91 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  35.37 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  32.91 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  39.29 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  32.99 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3307  rhodanese domain-containing protein  30.95 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  26.09 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  33.73 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  26.09 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  32.98 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  32.53 
 
 		 247 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  30.12 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  38.37 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  25.47 
 
 		 177 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  30 
 
 		 173 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  28.1 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  30.23 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0678  rhodanese-like protein  30.43 
 
 		 401 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.622569  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1355  rhodanese-like protein  30.21 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  32.63 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 228 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  32.53 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2149  rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.262587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  32.11 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  30.59 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.53 
 
 		 389 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  30.84 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  32.29 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  27.01 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  23.23 
 
 		 252 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  30 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  27.03 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  29 
 
 		 186 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  29 
 
 		 186 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  25.9 
 
 		 252 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  26.04 
 
 		 146 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  32.05 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 		 144 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  26.04 
 
 		 124 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  35.44 
 
 		 146 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  29 
 
 		 186 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  34.48 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  29.03 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 226 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  25.29 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  28.28 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0755  Rhodanese domain protein  28.77 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  29.1 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  38.57 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.12 
 
 		 393 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4364  Rhodanese domain protein  29.67 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4083  Rhodanese domain protein  29.67 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  41.2  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>