29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2303 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2303  rhodanese-like protein  100 
 
 
93 aa  183  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.788958  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2215  rhodanese-like protein  90.43 
 
 
94 aa  150  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.636017  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2035  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0490  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3541  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 
147 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3363  rhodanese domain-containing protein  37.89 
 
 
146 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0489  rhodanese domain-containing protein  36.59 
 
 
147 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0480  hypothetical protein  34.58 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4001  rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0494  hypothetical protein  34.09 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4476  rhodanese domain-containing protein  31.87 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3876  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0480  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0483  rhodanese domain-containing protein  33.75 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  37.68 
 
 
380 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  35.16 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  45.83 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2992  rhodanese-like domain-containing protein  38.3 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  42.62 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  36.25 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.67 
 
 
834 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  40 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  37.76 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  41.67 
 
 
130 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  44.26 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  34.33 
 
 
361 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1330  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 
112 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.434015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>