More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1330 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1330  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 112 aa  228  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.434015 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0678  Rhodanese domain protein  71.84 
 
 		 110 aa  153  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.682716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2435  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 106 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5070  rhodanese domain-containing protein  48.48 
 
 		 106 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.34245  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5363  Rhodanese domain protein  47.42 
 
 		 106 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  42.61 
 
 		 113 aa  81.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5025  Rhodanese domain protein  43.93 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.569347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  46 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  45 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  45.45 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2590  rhodanese domain-containing protein  44.76 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  41.75 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43 
 
 		 393 aa  70.1  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  42.42 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  41.41 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  41.3 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  36.45 
 
 		 103 aa  67  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  40.38 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  40.4 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  43.01 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 113 aa  62  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  39.39 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  45.78 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  34.95 
 
 		 423 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 284 aa  60.1  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  39.18 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  37.86 
 
 		 471 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  40 
 
 		 393 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.11 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  34.31 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  35.65 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.14 
 
 		 392 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  37.86 
 
 		 389 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  39.39 
 
 		 476 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  34.31 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.39 
 
 		 386 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  39.53 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  34.86 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 		 122 aa  57  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0994  hypothetical protein  32.04 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186232  normal  0.0867734 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  32.71 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  41.46 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  35.42 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3170  Rhodanese domain protein  42.7 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.212738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  34.86 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.37 
 
 		 396 aa  55.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0718  UBA/THIF-type NAD/FAD-binding protein  33.01 
 
 		 390 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  31.63 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  34.29 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3386  hypothetical protein  33.01 
 
 		 387 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0847115 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  35.45 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  38.75 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  34.17 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  41.05 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.24 
 
 		 403 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  31.82 
 
 		 361 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  35.09 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 224 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3191  hypothetical protein  33.01 
 
 		 390 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.755733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2905  hypothetical protein  33.01 
 
 		 390 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  37.23 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  32.41 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  35.87 
 
 		 177 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  31.19 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  38.2 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  31.63 
 
 		 279 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  36.63 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  39.51 
 
 		 282 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  35.24 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05040  endoplasmic reticulum protein, putative  31.82 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.575301  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.69 
 
 		 386 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  33.9 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  30.85 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  38.78 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  42.55 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1871  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 		 342 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  32.74 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  37.23 
 
 		 178 aa  52  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1907  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.15 
 
 		 364 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  39.6 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  33.65 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  34.29 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1713  putative lipoprotein  40 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  35.64 
 
 		 118 aa  51.2  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  31.01 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  38.24 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  29.91 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  34.29 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0158  hypothetical protein  34.62 
 
 		 391 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  36.63 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>