87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0483 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0483  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 151 aa  317  5e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  77.62 
 
 		 143 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0494  hypothetical protein  78.87 
 
 		 142 aa  240  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  73.83 
 
 		 152 aa  237  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4476  rhodanese domain-containing protein  74.65 
 
 		 142 aa  235  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0480  rhodanese domain-containing protein  75.35 
 
 		 142 aa  235  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4001  rhodanese domain-containing protein  63.7 
 
 		 146 aa  199  9e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3363  rhodanese domain-containing protein  61.74 
 
 		 146 aa  199  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3876  rhodanese domain-containing protein  64.93 
 
 		 147 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0480  hypothetical protein  63.01 
 
 		 146 aa  197  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0490  rhodanese domain-containing protein  71.67 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3541  rhodanese domain-containing protein  71.67 
 
 		 147 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0489  rhodanese domain-containing protein  70.83 
 
 		 147 aa  193  9e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  70.49 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  39.6 
 
 		 689 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  36.63 
 
 		 688 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  37.68 
 
 		 377 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  34.74 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2035  rhodanese domain-containing protein  29.7 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685184 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  32.67 
 
 		 670 aa  52.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  30.53 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  34.09 
 
 		 363 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.38 
 
 		 389 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  31.76 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2215  rhodanese-like protein  40.35 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.636017  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  30.59 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  33.77 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  31.51 
 
 		 406 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2303  rhodanese-like protein  40.35 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.788958  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  28.71 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  25.16 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  29.46 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  28.09 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  28.09 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  37.74 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  28.43 
 
 		 171 aa  46.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  30.53 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  37.18 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  36.11 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  37.18 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  28 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  39.62 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  37.68 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  30.69 
 
 		 454 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  32.39 
 
 		 432 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  23.27 
 
 		 177 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.11 
 
 		 393 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  29.87 
 
 		 174 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  28.92 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  35.37 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  32.61 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1355  rhodanese-like protein  27.27 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100985  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  31 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  32.53 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0755  Rhodanese domain protein  31.51 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  26.19 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  30.12 
 
 		 247 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  30.21 
 
 		 171 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  28.87 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  29 
 
 		 144 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 119 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  26.72 
 
 		 150 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3307  rhodanese domain-containing protein  27.41 
 
 		 179 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 228 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  28.95 
 
 		 145 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  25.2 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 226 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  25.29 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  23.58 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  29.11 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  29.11 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  26.6 
 
 		 254 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  31.33 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  23.58 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  30.11 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  26.53 
 
 		 353 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  26.92 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  27.66 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  27.18 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  27.18 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  27.18 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  26.55 
 
 		 685 aa  40.4  0.008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  29.01 
 
 		 144 aa  40  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>