173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5891 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  100 
 
 
146 aa  296  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2088  hypothetical protein  84.67 
 
 
169 aa  239  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0947585  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  70.54 
 
 
144 aa  191  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0777  rhodanese-like protein  70.23 
 
 
139 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808709  normal  0.0344492 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  62.31 
 
 
142 aa  179  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  70.23 
 
 
139 aa  172  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  70.23 
 
 
139 aa  172  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  63.16 
 
 
134 aa  169  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  62.79 
 
 
166 aa  164  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  57.14 
 
 
144 aa  163  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  59.06 
 
 
136 aa  159  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  59.38 
 
 
136 aa  158  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5372  rhodanese domain-containing protein  71.76 
 
 
139 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0673577  normal  0.0625322 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4349  rhodanese domain-containing protein  74.05 
 
 
139 aa  156  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000446887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4865  rhodanese domain-containing protein  74.05 
 
 
139 aa  156  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22928  hitchhiker  0.000154413 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  71.76 
 
 
141 aa  154  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4402  rhodanese domain-containing protein  56.62 
 
 
141 aa  153  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2213  rhodanese-like domain-containing protein  64.29 
 
 
155 aa  146  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00171016  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0834  rhodanese-like domain-containing protein  66.41 
 
 
155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0054  rhodanese-like domain-containing protein  66.41 
 
 
155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0184557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0963  rhodanese domain-containing protein  66.41 
 
 
155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144935  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0871  rhodanese domain-containing protein  66.41 
 
 
155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1566  rhodanese-like domain-containing protein  66.41 
 
 
155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1986  rhodanese domain-containing protein  55.3 
 
 
137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  55.04 
 
 
145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4425  Rhodanese domain protein  56.82 
 
 
129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1761  rhodanese-like domain-containing protein  65.65 
 
 
174 aa  144  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2149  rhodanese domain protein  53.79 
 
 
131 aa  141  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.262587  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  46.85 
 
 
159 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  39.85 
 
 
138 aa  96.7  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03114  hypothetical protein  35.9 
 
 
133 aa  88.2  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0450436  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  34.51 
 
 
133 aa  84.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  29.57 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0872  rhodanese domain-containing protein  33.91 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  34.21 
 
 
241 aa  78.2  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  36.23 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  38.33 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  29.91 
 
 
124 aa  61.6  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  29.91 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
226 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  34.38 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
227 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  34.09 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 
221 aa  54.7  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
189 aa  53.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
221 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
184 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  38.2 
 
 
170 aa  50.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 
227 aa  50.4  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
224 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
224 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  40.51 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 
221 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
224 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
224 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
224 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
230 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
226 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 
222 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
222 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 
218 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  31.78 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
221 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  32.56 
 
 
112 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  32.32 
 
 
247 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
233 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  31 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  32.18 
 
 
112 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  31.48 
 
 
269 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  34.95 
 
 
555 aa  47.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  28.93 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  32.91 
 
 
280 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  32.18 
 
 
221 aa  47.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  36.9 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
223 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  30.23 
 
 
221 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  30.84 
 
 
145 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
221 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
220 aa  47  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  29.75 
 
 
124 aa  47  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
227 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
124 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  31.78 
 
 
223 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
224 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  27.34 
 
 
218 aa  47  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  34.57 
 
 
124 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.2 
 
 
383 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  34.44 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
253 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
235 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3059  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.865399  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
235 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
235 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1172  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
232 aa  45.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  41.33 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  31.91 
 
 
480 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  32.58 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1508  Rhodanese domain protein  32.91 
 
 
352 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>