81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1058 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 178 aa  370  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  66.24 
 
 		 174 aa  222  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  53.14 
 
 		 173 aa  205  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  62.24 
 
 		 173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  52.25 
 
 		 173 aa  187  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3307  rhodanese domain-containing protein  39.87 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0678  rhodanese-like protein  37.39 
 
 		 401 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.622569  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  30.43 
 
 		 363 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 		 432 aa  58.2  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  33.88 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  33.01 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  32.2 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 112 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  33.86 
 
 		 388 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  32.97 
 
 		 112 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  30.65 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  30.97 
 
 		 112 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  41.07 
 
 		 152 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  30.16 
 
 		 118 aa  52  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  30.77 
 
 		 177 aa  51.6  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  39.66 
 
 		 143 aa  51.2  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  27.74 
 
 		 128 aa  51.2  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  27.27 
 
 		 124 aa  51.2  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  27.74 
 
 		 128 aa  51.2  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1524  rhodanese domain-containing protein  28.23 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  26.52 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1355  rhodanese-like protein  28.17 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100985  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  30.36 
 
 		 252 aa  48.9  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3876  rhodanese domain-containing protein  29.9 
 
 		 147 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  30.71 
 
 		 141 aa  48.5  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  30.71 
 
 		 141 aa  48.5  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2334  rhodanese-like protein  32.97 
 
 		 123 aa  48.1  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.590986  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  34.26 
 
 		 141 aa  48.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  27.27 
 
 		 252 aa  47.8  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0480  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 		 142 aa  47.8  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  30.71 
 
 		 423 aa  47.8  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  27.05 
 
 		 164 aa  47.8  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  26.77 
 
 		 136 aa  47.8  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  29.82 
 
 		 114 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0490  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0480  hypothetical protein  39.62 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0483  rhodanese domain-containing protein  37.74 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  28.69 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3541  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0489  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  34.51 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  32.98 
 
 		 380 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  31.07 
 
 		 406 aa  46.6  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4001  rhodanese domain-containing protein  37.74 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3363  rhodanese domain-containing protein  37.74 
 
 		 146 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  24.56 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  29.41 
 
 		 173 aa  45.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  28.81 
 
 		 269 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  26.27 
 
 		 164 aa  44.7  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  32.08 
 
 		 142 aa  44.7  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4476  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 142 aa  44.7  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  32.11 
 
 		 278 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  29.1 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2980  Rhodanese domain protein  28.47 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.569318 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0494  hypothetical protein  37.5 
 
 		 142 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  26.17 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  29.81 
 
 		 480 aa  43.9  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0505  rhodanese-like domain-containing protein  27.43 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3137  hypothetical protein  24.34 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  30.08 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  44 
 
 		 438 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  25.42 
 
 		 129 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 141 aa  42.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  31.78 
 
 		 141 aa  42  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  25.83 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.89 
 
 		 389 aa  42  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  25.41 
 
 		 129 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2174  rhodanese domain-containing protein  27.94 
 
 		 186 aa  42  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0733283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  26.55 
 
 		 113 aa  42  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  25.98 
 
 		 137 aa  42  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2666  hypothetical protein  24.87 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0474278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 141 aa  41.2  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  34 
 
 		 229 aa  41.2  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  23.33 
 
 		 110 aa  41.2  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3184  rhodanese  28.46 
 
 		 200 aa  40.8  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>