More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5372 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5372  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
139 aa  283  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0673577  normal  0.0625322 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  95.68 
 
 
139 aa  259  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  95.68 
 
 
139 aa  259  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0777  rhodanese-like protein  90.58 
 
 
139 aa  257  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808709  normal  0.0344492 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  85.51 
 
 
141 aa  208  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  75.19 
 
 
144 aa  208  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4349  rhodanese domain-containing protein  84.78 
 
 
139 aa  205  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000446887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4865  rhodanese domain-containing protein  84.06 
 
 
139 aa  203  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22928  hitchhiker  0.000154413 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  71.76 
 
 
146 aa  188  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2088  hypothetical protein  71.97 
 
 
169 aa  184  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0947585  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  68.99 
 
 
166 aa  183  7e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1566  rhodanese-like domain-containing protein  82.03 
 
 
155 aa  177  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  70.63 
 
 
134 aa  177  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0834  rhodanese-like domain-containing protein  82.03 
 
 
155 aa  177  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0871  rhodanese domain-containing protein  82.03 
 
 
155 aa  177  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0054  rhodanese-like domain-containing protein  82.03 
 
 
155 aa  177  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0184557  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2213  rhodanese-like domain-containing protein  82.03 
 
 
155 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00171016  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1761  rhodanese-like domain-containing protein  79.84 
 
 
174 aa  176  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0963  rhodanese domain-containing protein  81.25 
 
 
155 aa  176  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144935  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  65.62 
 
 
142 aa  174  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  64.57 
 
 
144 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  58.82 
 
 
145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  58.21 
 
 
136 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  61.83 
 
 
136 aa  157  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2149  rhodanese domain protein  56.49 
 
 
131 aa  154  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.262587  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4425  Rhodanese domain protein  58.91 
 
 
129 aa  154  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1986  rhodanese domain-containing protein  58.02 
 
 
137 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4402  rhodanese domain-containing protein  58.09 
 
 
141 aa  152  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  48.84 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  44.92 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03114  hypothetical protein  39.13 
 
 
133 aa  93.6  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0450436  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  36.04 
 
 
133 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  38.32 
 
 
241 aa  83.6  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0872  rhodanese domain-containing protein  36.04 
 
 
131 aa  83.6  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  30.63 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  30.63 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  40.62 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
230 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
224 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
224 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
224 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
224 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 
221 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
224 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
221 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  37.19 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
227 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  34.83 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  40.38 
 
 
380 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 
218 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
253 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  31.73 
 
 
124 aa  58.2  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
189 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  31.73 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2038  rhodanese domain-containing protein  38.82 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2179  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  39.33 
 
 
116 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
224 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  33.71 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2739  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
220 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0533498  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  38.2 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
222 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.67 
 
 
393 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0075  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 
218 aa  55.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  37.21 
 
 
480 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  34.83 
 
 
247 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1278  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
231 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.180316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
228 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  39.58 
 
 
126 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
233 aa  53.9  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  36.17 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  46 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
235 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
235 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  36.9 
 
 
223 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
235 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2645  Rhodanese domain protein  32.29 
 
 
147 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.799  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  32.61 
 
 
480 aa  51.6  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
226 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 
221 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
221 aa  51.2  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  46.94 
 
 
136 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 
226 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
277 aa  50.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  34.52 
 
 
269 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  35.56 
 
 
124 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  35.56 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5326  rhodanese-like domain protein  32.91 
 
 
137 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
221 aa  50.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0092  rhodanese-like protein  32.91 
 
 
184 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022207  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  37.5 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3257  rhodanese domain-containing protein  37.35 
 
 
221 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0639581  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  36.62 
 
 
463 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1275  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 
257 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  31.52 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3240  regulatory protein, ArsR  32.94 
 
 
221 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.135637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>