217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2078 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 132 aa  275  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  99.24 
 
 		 132 aa  274  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  83.33 
 
 		 133 aa  243  9e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03114  hypothetical protein  66.67 
 
 		 133 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0450436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  58.91 
 
 		 241 aa  164  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0872  rhodanese domain-containing protein  53.12 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  34.59 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  33.06 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  33.91 
 
 		 159 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  32.56 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  34.86 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  31.48 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  32.14 
 
 		 136 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  33.62 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  29.57 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  31.03 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0777  rhodanese-like protein  30.63 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808709  normal  0.0344492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1761  rhodanese-like domain-containing protein  37.14 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2088  hypothetical protein  30.97 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0947585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  39.09 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  39.09 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  33.03 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4425  Rhodanese domain protein  34.51 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4349  rhodanese domain-containing protein  33.03 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000446887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4865  rhodanese domain-containing protein  33.03 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22928  hitchhiker  0.000154413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2149  rhodanese domain protein  34.82 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.262587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  29.36 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  29.36 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4402  rhodanese domain-containing protein  31.86 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  30.65 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1986  rhodanese domain-containing protein  29.57 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0834  rhodanese-like domain-containing protein  35.58 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2213  rhodanese-like domain-containing protein  35.58 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00171016  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0054  rhodanese-like domain-containing protein  35.58 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0184557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0963  rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144935  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0871  rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1566  rhodanese-like domain-containing protein  35.58 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5372  rhodanese domain-containing protein  30.28 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0673577  normal  0.0625322 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 227 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  35.87 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2905  ArsR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  32.65 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  30 
 
 		 247 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  35.56 
 
 		 164 aa  52.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4884  rhodanese-like protein  35.96 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2736  ArsR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 227 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 228 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0334  rhodanese-like protein  40.45 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206424  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 		 252 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5326  rhodanese-like domain protein  35.16 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 253 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0320  thiamine biosynthesis protein ThiI  35.96 
 
 		 484 aa  50.4  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 226 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2523  rhodanese-related sulfurtransferase  30.39 
 
 		 170 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000271872  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 233 aa  50.1  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  29.35 
 
 		 221 aa  50.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  31.46 
 
 		 112 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 222 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  31.73 
 
 		 222 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 221 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  35.85 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  31.58 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 		 226 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  31.4 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  37.36 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0356  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  31.58 
 
 		 377 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  31.58 
 
 		 363 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  32.58 
 
 		 346 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  30.11 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  34.34 
 
 		 380 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3468  transcriptional activator domain-containing protein  31.4 
 
 		 223 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3920  rhodanese domain-containing protein  32.58 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.305185  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  33 
 
 		 432 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0124  rhodanese domain-containing protein  39.53 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3838  rhodanese domain-containing protein  32.94 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2508  rhodanese domain-containing protein  35.23 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33 
 
 		 813 aa  47  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2629  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 		 108 aa  47  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  28.89 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1658  Rhodanese domain protein  32.97 
 
 		 252 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.329991  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0382  ArsR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  24.42 
 
 		 227 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1222  ArsR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 224 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1571  ArsR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.543844  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1758  ArsR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2862  ArsR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0425  ArsR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 230 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2946  cyclic nucleotide-binding protein  34.25 
 
 		 369 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360561  normal  0.390891 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  31.03 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 223 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  32.63 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  28.42 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3128  ArsR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 223 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141213  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>