182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03114 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03114  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  279  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0450436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3657  Rhodanese domain protein  68.42 
 
 		 133 aa  202  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2472  rhodanese domain-containing protein  66.67 
 
 		 132 aa  197  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.86428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2078  rhodanese domain-containing protein  66.67 
 
 		 132 aa  197  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.04221  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4212  Rhodanese domain protein  60.61 
 
 		 241 aa  174  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.204414  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0872  rhodanese domain-containing protein  56.25 
 
 		 131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2063  rhodanese-like protein  40.91 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2642  rhodanese domain-containing protein  39.66 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4736  rhodanese domain-containing protein  40.71 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705468  normal  0.163303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2147  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1235  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6431  rhodanese domain-containing protein  38.32 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.940174 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0777  rhodanese-like protein  37.72 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.808709  normal  0.0344492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5891  Rhodanese domain protein  35.9 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3698  rhodanese domain-containing protein  40.74 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562484  normal  0.386083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  36.11 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0188  hypothetical protein  35.96 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7122  rhodanese domain-containing protein  37.61 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3452  rhodanese-like protein  37.04 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.647498  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4914  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367762  normal  0.616913 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2088  hypothetical protein  36.75 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0947585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1761  rhodanese-like domain-containing protein  40.95 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637912  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3032  Rhodanese domain protein  34.26 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00401141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4349  rhodanese domain-containing protein  39.81 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000446887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4865  rhodanese domain-containing protein  39.81 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22928  hitchhiker  0.000154413 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5372  rhodanese domain-containing protein  37.96 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0673577  normal  0.0625322 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2149  rhodanese domain protein  39.29 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.262587  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0834  rhodanese-like domain-containing protein  37.82 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2213  rhodanese-like domain-containing protein  38.46 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00171016  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0054  rhodanese-like domain-containing protein  37.82 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0184557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0963  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144935  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0871  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1566  rhodanese-like domain-containing protein  37.82 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0532908  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4425  Rhodanese domain protein  36.28 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  38.6 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1986  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  36.28 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4402  rhodanese domain-containing protein  35.65 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1000  putative sulfurtransferase  35.29 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.308152  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1130  rhodanese-related sulfurtransferase  35.29 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  32.69 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  38.64 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0576  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00003083  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 233 aa  53.9  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  36.73 
 
 		 377 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  31.68 
 
 		 172 aa  52.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  31.78 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  32.98 
 
 		 363 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1961  transcriptional regulator, ArsR family  35.23 
 
 		 222 aa  50.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.172252  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1715  transcriptional regulator, ArsR family  30.48 
 
 		 221 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  34.04 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  32.14 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 227 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  30.19 
 
 		 280 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0605  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.245257  normal  0.38785 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  34.04 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  30.95 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2101  ArsR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 222 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  37.76 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  32.74 
 
 		 218 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  31.71 
 
 		 252 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  27.59 
 
 		 227 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.47 
 
 		 813 aa  47  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2662  rhodanese domain-containing protein  29.9 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.553385  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  32.22 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.35 
 
 		 393 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5326  rhodanese-like domain protein  32.22 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 253 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  30.43 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1401  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.328336  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 228 aa  46.2  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 221 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  32.99 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  34.44 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  32.94 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  37.5 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  32.94 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0334  rhodanese-like protein  33.71 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206424  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  33.68 
 
 		 171 aa  45.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  29.47 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  31.46 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0008  rhodanese-like protein  29.13 
 
 		 380 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.612514 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2204  transcriptional regulator, ArsR family  28.89 
 
 		 221 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.345359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  36.47 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  36.67 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.73 
 
 		 568 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  31.18 
 
 		 226 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  32.95 
 
 		 185 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4884  rhodanese-like protein  31.46 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  31.52 
 
 		 432 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3468  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 		 221 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  37.21 
 
 		 389 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>