188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1130 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  100 
 
 		 548 aa  1096    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  53.41 
 
 		 523 aa  502  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  53.6 
 
 		 530 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  51.7 
 
 		 551 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  50.66 
 
 		 529 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  50.28 
 
 		 529 aa  482  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  50.95 
 
 		 931 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  50.75 
 
 		 896 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  50.56 
 
 		 528 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  49.81 
 
 		 538 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  50.66 
 
 		 531 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  41.65 
 
 		 526 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  42.72 
 
 		 527 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  42.53 
 
 		 527 aa  359  8e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  41.9 
 
 		 528 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  42.44 
 
 		 535 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  42.94 
 
 		 533 aa  339  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  42.13 
 
 		 527 aa  335  9e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  40.38 
 
 		 527 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  42.37 
 
 		 533 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  40.75 
 
 		 532 aa  332  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 		 535 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  41.87 
 
 		 549 aa  325  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  41.87 
 
 		 549 aa  325  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  41.45 
 
 		 569 aa  323  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  40.61 
 
 		 525 aa  323  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  41.19 
 
 		 541 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  40.45 
 
 		 568 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 		 568 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  41 
 
 		 555 aa  320  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  40.26 
 
 		 541 aa  320  6e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  40.26 
 
 		 541 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  41.81 
 
 		 774 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  40.26 
 
 		 739 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  39.96 
 
 		 569 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  38.66 
 
 		 545 aa  305  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  41.64 
 
 		 539 aa  303  8.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  37.02 
 
 		 528 aa  296  7e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  39.56 
 
 		 555 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  42.12 
 
 		 411 aa  262  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 		 380 aa  221  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  40.62 
 
 		 361 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  34.31 
 
 		 521 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  33.9 
 
 		 549 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  27.07 
 
 		 247 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  37.04 
 
 		 123 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  30.53 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  25.45 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  22.88 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  28.96 
 
 		 220 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  32.32 
 
 		 124 aa  61.6  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  32.32 
 
 		 124 aa  61.6  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  31.19 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  23.47 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  56.2  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  28.85 
 
 		 216 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 459 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 459 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 459 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  37.89 
 
 		 125 aa  54.3  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  31.73 
 
 		 123 aa  54.3  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  36.84 
 
 		 459 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 459 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  26.41 
 
 		 265 aa  54.3  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 459 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  30.86 
 
 		 189 aa  53.5  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  35.54 
 
 		 119 aa  53.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.23 
 
 		 388 aa  52.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3833  rhodanese domain-containing protein  32.69 
 
 		 218 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  29.36 
 
 		 189 aa  52.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  31.25 
 
 		 189 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 		 129 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  27.1 
 
 		 457 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3494  Rhodanese domain protein  34.31 
 
 		 112 aa  51.2  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28130  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  38.27 
 
 		 502 aa  51.2  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  31.13 
 
 		 472 aa  50.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  34.48 
 
 		 346 aa  50.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  36.04 
 
 		 461 aa  50.8  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 129 aa  50.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  30.33 
 
 		 123 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  28.43 
 
 		 99 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  32.71 
 
 		 128 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  32.71 
 
 		 128 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 		 470 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 		 113 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.29 
 
 		 389 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  32.17 
 
 		 146 aa  49.3  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  30 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  34.12 
 
 		 145 aa  49.3  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  28.7 
 
 		 480 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  32.43 
 
 		 466 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  32.71 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1440  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 		 171 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000930131  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  32.17 
 
 		 146 aa  49.3  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  37.89 
 
 		 460 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  31.96 
 
 		 133 aa  48.5  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 143 aa  48.9  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2577  Rhodanese domain protein  33.68 
 
 		 113 aa  48.9  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000018103  decreased coverage  0.0000278243 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  30.97 
 
 		 459 aa  48.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  31.43 
 
 		 140 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>