265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2586 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 
361 aa  711    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
380 aa  336  2.9999999999999997e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  40.77 
 
 
527 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  40.18 
 
 
527 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  42.26 
 
 
528 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  41.14 
 
 
527 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  40.97 
 
 
523 aa  232  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  42.51 
 
 
774 aa  222  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  42.02 
 
 
527 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  37.14 
 
 
529 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  38.57 
 
 
551 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  40.11 
 
 
541 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  40.87 
 
 
532 aa  215  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  39.76 
 
 
533 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  38 
 
 
531 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  39.08 
 
 
528 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  38.94 
 
 
535 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  42.04 
 
 
739 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  39.47 
 
 
525 aa  213  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 
535 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  38.58 
 
 
533 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  37.72 
 
 
528 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  41.54 
 
 
549 aa  209  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  41.54 
 
 
549 aa  209  7e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  36.68 
 
 
529 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  35.88 
 
 
526 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 
411 aa  207  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  40.62 
 
 
548 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  38.12 
 
 
538 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  39.6 
 
 
555 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  39.31 
 
 
541 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  38.3 
 
 
568 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  38.3 
 
 
568 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  37.76 
 
 
539 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 
545 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  37.98 
 
 
541 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  37.72 
 
 
569 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  38.44 
 
 
569 aa  195  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  36.58 
 
 
530 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  39.21 
 
 
555 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  37.17 
 
 
896 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  35.48 
 
 
931 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  37.23 
 
 
521 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  30.81 
 
 
549 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  30.23 
 
 
216 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  33.94 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.65 
 
 
393 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  22.17 
 
 
247 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  26.72 
 
 
388 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  30.05 
 
 
220 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  31.73 
 
 
150 aa  60.1  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 
480 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  31.91 
 
 
124 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  34.29 
 
 
116 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
480 aa  57  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  30.85 
 
 
124 aa  57  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  32.98 
 
 
150 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  32.41 
 
 
325 aa  56.2  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  25.57 
 
 
454 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1513  Rhodanese domain protein  28.73 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  36.44 
 
 
143 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  29.79 
 
 
133 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 
222 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  25.57 
 
 
230 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  22.94 
 
 
252 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  26.32 
 
 
99 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  32.71 
 
 
119 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  25.5 
 
 
423 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 
472 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  20.46 
 
 
363 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  33 
 
 
455 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  31.13 
 
 
132 aa  53.9  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 
144 aa  53.9  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.5 
 
 
380 aa  53.9  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0795  rhodanese-like domain-containing protein  36.73 
 
 
102 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.58 
 
 
389 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
226 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
233 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  26.32 
 
 
99 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  27.46 
 
 
354 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  31.07 
 
 
103 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  39.08 
 
 
192 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  29.79 
 
 
123 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  28.17 
 
 
457 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
172 aa  50.8  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 
225 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 
225 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  33.88 
 
 
277 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 
138 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  37.74 
 
 
282 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  33.04 
 
 
201 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  35.56 
 
 
197 aa  50.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1363  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
227 aa  50.4  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  29.63 
 
 
124 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  31.11 
 
 
141 aa  50.1  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  31.11 
 
 
141 aa  50.1  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  35.23 
 
 
142 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  21.91 
 
 
406 aa  50.1  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3285  Rhodanese domain protein  37 
 
 
136 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654327  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.03 
 
 
388 aa  50.1  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>