178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3935 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
526 aa  1090    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  43.24 
 
 
529 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  43.16 
 
 
529 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  44.02 
 
 
528 aa  422  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  43.16 
 
 
523 aa  415  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  43.19 
 
 
551 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  44.51 
 
 
531 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  42.94 
 
 
530 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  41.52 
 
 
931 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  42.86 
 
 
538 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  41.65 
 
 
548 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  42.75 
 
 
896 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 
535 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  37.38 
 
 
535 aa  313  6.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  38.03 
 
 
527 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  36.94 
 
 
527 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  36.85 
 
 
739 aa  309  6.999999999999999e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
545 aa  306  7e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  37.28 
 
 
527 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  37.11 
 
 
528 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  35.99 
 
 
533 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  35.93 
 
 
533 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  36.03 
 
 
774 aa  289  9e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  36.12 
 
 
532 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  36.88 
 
 
541 aa  286  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  35.87 
 
 
525 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  36.63 
 
 
527 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  36.96 
 
 
528 aa  277  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  35.24 
 
 
555 aa  273  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  35.73 
 
 
549 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  35.73 
 
 
549 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  34.86 
 
 
541 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  34.55 
 
 
541 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  34.79 
 
 
569 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  35.02 
 
 
568 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  35.02 
 
 
568 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  39.08 
 
 
411 aa  258  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  38.33 
 
 
569 aa  257  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 
555 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  33.33 
 
 
539 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  38.42 
 
 
380 aa  254  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  29.62 
 
 
521 aa  207  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  35.88 
 
 
361 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  30.68 
 
 
549 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  22.71 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  24.77 
 
 
252 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  26.87 
 
 
247 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  25.69 
 
 
220 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  30.77 
 
 
119 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  23.74 
 
 
216 aa  57.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  29.02 
 
 
457 aa  57  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  24.59 
 
 
423 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  21.75 
 
 
377 aa  56.2  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  29.89 
 
 
132 aa  55.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  34.52 
 
 
140 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  37.1 
 
 
127 aa  54.7  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  28.85 
 
 
124 aa  54.3  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  29.63 
 
 
123 aa  53.9  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  27.88 
 
 
124 aa  52.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  31.4 
 
 
141 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  31.51 
 
 
144 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 
459 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  33.85 
 
 
138 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  31.68 
 
 
113 aa  50.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  38.36 
 
 
129 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  29.07 
 
 
141 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  29.9 
 
 
138 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  31.91 
 
 
128 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 
128 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  38.36 
 
 
130 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  30.86 
 
 
133 aa  49.3  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  39.68 
 
 
130 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  36.99 
 
 
130 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  26.89 
 
 
123 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
226 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  22.19 
 
 
406 aa  48.9  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2508  rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 
149 aa  48.5  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 
617 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  28.04 
 
 
123 aa  48.5  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  29.76 
 
 
135 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  29.76 
 
 
135 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  30.85 
 
 
140 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
143 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2429  beta-lactamase domain protein  30.51 
 
 
464 aa  48.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00447087  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
138 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  29.76 
 
 
135 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  29.76 
 
 
135 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  29.76 
 
 
135 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  29.76 
 
 
135 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  29.76 
 
 
135 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  30.59 
 
 
130 aa  48.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  29.76 
 
 
135 aa  47.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  34.72 
 
 
125 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0892  Rhodanese domain protein  34.02 
 
 
125 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.65 
 
 
627 aa  47.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  30.84 
 
 
142 aa  47.4  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  32.31 
 
 
132 aa  47.4  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  22.87 
 
 
388 aa  47.4  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  26.05 
 
 
123 aa  47  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  31.34 
 
 
127 aa  47  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>