More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1374 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1374  rhodanese-like protein  100 
 
 
245 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0706791  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0733  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  55.51 
 
 
247 aa  277  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168606  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.24 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1028  Rhodanese domain protein  31.2 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.006997  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.36 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  36.11 
 
 
390 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.14 
 
 
390 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  38.55 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.79 
 
 
393 aa  62  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  38.68 
 
 
163 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  35.19 
 
 
140 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  33.01 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0211  hypothetical protein  35.29 
 
 
98 aa  60.5  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2203  thioredoxin-related protein  36.59 
 
 
93 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 
154 aa  60.1  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 
117 aa  60.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1797  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.52 
 
 
397 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.171411 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2496  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.32 
 
 
399 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124873 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  33.83 
 
 
148 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  32.38 
 
 
105 aa  59.3  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  32.73 
 
 
130 aa  59.3  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1123  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.84 
 
 
396 aa  59.3  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4670  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.35 
 
 
392 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794416  normal  0.136136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1399  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.29 
 
 
400 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.57 
 
 
395 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1417  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.29 
 
 
400 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  37.97 
 
 
144 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  35.8 
 
 
99 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  35.8 
 
 
99 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  29.32 
 
 
150 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1252  hypothetical protein  38.16 
 
 
96 aa  57  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.026708  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 
220 aa  57  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  34.44 
 
 
141 aa  57  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0930  hypothetical protein  42.86 
 
 
97 aa  57  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0119442  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 
113 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1453  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.14 
 
 
400 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.640225  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0972  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33 
 
 
390 aa  56.2  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  39.77 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  41.56 
 
 
170 aa  56.6  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 
150 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  35.37 
 
 
107 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.33 
 
 
392 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  39.51 
 
 
102 aa  55.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  33.75 
 
 
278 aa  55.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  37.35 
 
 
241 aa  55.5  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  37.04 
 
 
173 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  27.73 
 
 
390 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2774  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.31 
 
 
399 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.165705  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.82 
 
 
383 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  35.44 
 
 
102 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
389 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  29.41 
 
 
390 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 
148 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.26 
 
 
831 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  36.99 
 
 
127 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  27.97 
 
 
398 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  30 
 
 
149 aa  53.1  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  34.94 
 
 
127 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  31.52 
 
 
133 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  31.13 
 
 
105 aa  52.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
282 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  34.94 
 
 
186 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  34.94 
 
 
186 aa  52.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  34.94 
 
 
186 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  34.94 
 
 
186 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  34.94 
 
 
186 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4822  Rhodanese domain protein  31.25 
 
 
173 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20859 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  32.32 
 
 
138 aa  52.4  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  35.35 
 
 
171 aa  52.4  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  32.53 
 
 
277 aa  52.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  34.94 
 
 
106 aa  52.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 
113 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1757  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 
134 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0421554  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.12 
 
 
388 aa  52.4  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.58 
 
 
813 aa  52.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  36.71 
 
 
386 aa  52  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 
142 aa  52  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.14 
 
 
817 aa  52  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  31.4 
 
 
377 aa  52  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1713  putative lipoprotein  40 
 
 
134 aa  51.2  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5503  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
146 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  33.77 
 
 
141 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  34.94 
 
 
127 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  35.37 
 
 
123 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  36.25 
 
 
113 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0980  thioredoxin-related protein  40.3 
 
 
95 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.744067  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.12 
 
 
395 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2112  rhodanese domain-containing protein  31.48 
 
 
114 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0658185  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  34.34 
 
 
129 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  35.71 
 
 
389 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  30.77 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1842  hypothetical protein  39.44 
 
 
92 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102769  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2920  hypothetical protein  31.76 
 
 
93 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.927487  hitchhiker  0.000209703 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  32.91 
 
 
141 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  34.94 
 
 
124 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  32.94 
 
 
116 aa  50.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  34.07 
 
 
130 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  36.25 
 
 
119 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0354  Rhodanese domain protein  33.8 
 
 
103 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00605821  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  36.71 
 
 
126 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>