41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1842 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1842  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  186  9e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102769  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0980  thioredoxin-related protein  65 
 
 		 95 aa  114  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.744067  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1252  hypothetical protein  56.1 
 
 		 96 aa  110  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.026708  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2203  thioredoxin-related protein  60.26 
 
 		 93 aa  107  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  50.56 
 
 		 241 aa  105  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2920  hypothetical protein  54.55 
 
 		 93 aa  94  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.927487  hitchhiker  0.000209703 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.33 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1407  hypothetical protein  40.7 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0211  hypothetical protein  40.91 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0349  hypothetical protein  43.33 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2967  hypothetical protein  43.33 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000688679  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0831  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.45 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.45968  normal  0.308889 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2384  hypothetical protein  40.96 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2738  hypothetical protein  42.86 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849161  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2934  hypothetical protein  45.83 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.180686 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.5 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0077  hypothetical protein  36.9 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.82 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00592628  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2100  hypothetical protein  40.85 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.375211 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2454  rubredoxin  44.12 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0927  putative ferredoxin-thioredoxin reductase,catalyticsubunit  37.08 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.091769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_187  rubredoxin-type iron-sulfur protein  39.51 
 
 		 168 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000349376  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0199  ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic subunit, putative/rubredoxin  36.9 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2432  rubredoxin  35.37 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000792123  normal  0.129833 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1734  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic chain  35.96 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.837813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2504  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  34.44 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.859232 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2283  ferredoxin thioredoxin reductase, catalytic beta chain  34.78 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.119617 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1374  rhodanese-like protein  39.44 
 
 		 245 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0706791  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3748  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  32.97 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.668578 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0403  ferredoxin thioredoxin reductase, catalytic beta chain  35.56 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1641  ferredoxin thioredoxin reductase, beta chain  32.22 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.872315  normal  0.552751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1567  ferredoxin thioredoxin reductase, beta chain  30.34 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.380841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0733  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  38.33 
 
 		 247 aa  47  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168606  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4385  ferredoxin thioredoxin reductase subunit beta  31.11 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1550  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  32.22 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.671529 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1523  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  32.22 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18254  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  30.95 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0305  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic subunit-like protein  31.25 
 
 		 582 aa  43.9  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5187  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  26.97 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0606  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  32.61 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50907  reductase of ferredoxin thioredoxin reductase  30.34 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>