30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0211 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0211  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  204  3e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1842  hypothetical protein  40.91 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102769  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1252  hypothetical protein  39.08 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.026708  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2203  thioredoxin-related protein  45.33 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  42.86 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2920  hypothetical protein  37.21 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.927487  hitchhiker  0.000209703 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0980  thioredoxin-related protein  43.28 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.744067  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_187  rubredoxin-type iron-sulfur protein  38.71 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000349376  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2967  hypothetical protein  34.52 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000688679  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2384  hypothetical protein  39.53 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0831  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.84 
 
 		 171 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.45968  normal  0.308889 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1407  hypothetical protein  32.94 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2934  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.180686 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0077  hypothetical protein  35.23 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0349  hypothetical protein  32.14 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1374  rhodanese-like protein  35.29 
 
 		 245 aa  60.5  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0706791  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2738  hypothetical protein  34.52 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849161  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2100  hypothetical protein  32.56 
 
 		 114 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.375211 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0733  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  36.05 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168606  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0199  ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic subunit, putative/rubredoxin  34.07 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.33 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00592628  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  31.03 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0927  putative ferredoxin-thioredoxin reductase,catalyticsubunit  39.44 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.091769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2454  rubredoxin  35.82 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  33.33 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2432  rubredoxin  34.78 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000792123  normal  0.129833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5187  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  30.12 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0305  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic subunit-like protein  30.67 
 
 		 582 aa  45.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0606  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  33.33 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2283  ferredoxin thioredoxin reductase, catalytic beta chain  29.79 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.119617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>