40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_187 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_187  rubredoxin-type iron-sulfur protein  100 
 
 		 168 aa  343  6e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000349376  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  79.04 
 
 		 167 aa  272  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00592628  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0199  ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic subunit, putative/rubredoxin  75 
 
 		 168 aa  269  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.23 
 
 		 163 aa  187  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0831  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.97 
 
 		 171 aa  181  6e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.45968  normal  0.308889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2454  rubredoxin  55.77 
 
 		 157 aa  179  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0927  putative ferredoxin-thioredoxin reductase,catalyticsubunit  52.94 
 
 		 167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.091769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2432  rubredoxin  51.55 
 
 		 167 aa  167  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000792123  normal  0.129833 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.29 
 
 		 172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0349  hypothetical protein  52.94 
 
 		 111 aa  105  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0077  hypothetical protein  52.04 
 
 		 116 aa  106  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2967  hypothetical protein  53.06 
 
 		 110 aa  104  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000688679  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1407  hypothetical protein  50 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2934  hypothetical protein  48.98 
 
 		 114 aa  99  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.180686 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2738  hypothetical protein  46.46 
 
 		 114 aa  99  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849161  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2100  hypothetical protein  47.96 
 
 		 114 aa  98.2  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.375211 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  36.14 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2203  thioredoxin-related protein  38.2 
 
 		 93 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2384  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0211  hypothetical protein  38.71 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1842  hypothetical protein  39.51 
 
 		 92 aa  67  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102769  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0980  thioredoxin-related protein  38.67 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.744067  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2920  hypothetical protein  35.06 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.927487  hitchhiker  0.000209703 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1252  hypothetical protein  35.62 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.026708  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0305  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic subunit-like protein  33.33 
 
 		 582 aa  53.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  39.71 
 
 		 878 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  39.71 
 
 		 878 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  54.55 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  42.86 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  54.55 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  50 
 
 		 884 aa  43.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  35.94 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1529  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 		 209 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00138894  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24760  conserved protein of DIM6/NTAB family  53.12 
 
 		 229 aa  42.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  60.61 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  54.55 
 
 		 190 aa  41.6  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  39.34 
 
 		 191 aa  41.2  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  42.86 
 
 		 190 aa  40.8  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0606  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  29.59 
 
 		 161 aa  40.8  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  43.75 
 
 		 392 aa  40.8  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>