25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2967 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2967  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  228  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000688679  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1407  hypothetical protein  69.44 
 
 		 119 aa  165  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0349  hypothetical protein  67.27 
 
 		 111 aa  161  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0077  hypothetical protein  65.74 
 
 		 116 aa  158  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2738  hypothetical protein  62.04 
 
 		 114 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849161  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2934  hypothetical protein  59.81 
 
 		 114 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.180686 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2100  hypothetical protein  59.81 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.375211 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55 
 
 		 163 aa  117  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  57.58 
 
 		 172 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2454  rubredoxin  56.25 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0831  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.49 
 
 		 171 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.45968  normal  0.308889 
 
 
-
 
NC_002936  DET0199  ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic subunit, putative/rubredoxin  52.53 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_187  rubredoxin-type iron-sulfur protein  53.06 
 
 		 168 aa  104  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000349376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2432  rubredoxin  48.08 
 
 		 167 aa  103  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000792123  normal  0.129833 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.58 
 
 		 167 aa  103  9e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00592628  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0927  putative ferredoxin-thioredoxin reductase,catalyticsubunit  45.54 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.091769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1842  hypothetical protein  43.33 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102769  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2203  thioredoxin-related protein  37.21 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0980  thioredoxin-related protein  44.12 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.744067  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2920  hypothetical protein  39.51 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.927487  hitchhiker  0.000209703 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  33.33 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0211  hypothetical protein  34.52 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2384  hypothetical protein  36.14 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0305  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic subunit-like protein  33.73 
 
 		 582 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1252  hypothetical protein  34.72 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.026708  normal  0.181235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>