36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2920 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2920  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  194  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.927487  hitchhiker  0.000209703 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  62.64 
 
 		 241 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2203  thioredoxin-related protein  51.65 
 
 		 93 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0980  thioredoxin-related protein  56.41 
 
 		 95 aa  107  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.744067  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1842  hypothetical protein  54.55 
 
 		 92 aa  94  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102769  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1252  hypothetical protein  42.35 
 
 		 96 aa  90.5  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.026708  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2384  hypothetical protein  38.46 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0349  hypothetical protein  35.37 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0211  hypothetical protein  37.21 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2967  hypothetical protein  39.51 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000688679  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0831  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.83 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.45968  normal  0.308889 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.36 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.33 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00592628  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2100  hypothetical protein  35.8 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.375211 
 
 
-
 
NC_002936  DET0199  ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic subunit, putative/rubredoxin  36 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0927  putative ferredoxin-thioredoxin reductase,catalyticsubunit  36.36 
 
 		 167 aa  67  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.091769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2934  hypothetical protein  35.8 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.180686 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.15 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2454  rubredoxin  39.19 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2738  hypothetical protein  34.57 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849161  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_187  rubredoxin-type iron-sulfur protein  35.06 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000349376  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1407  hypothetical protein  31.33 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0077  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2432  rubredoxin  36.59 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000792123  normal  0.129833 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0305  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic subunit-like protein  35.96 
 
 		 582 aa  52  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0606  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  32.56 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0733  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  31.4 
 
 		 247 aa  51.2  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0168606  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1374  rhodanese-like protein  31.76 
 
 		 245 aa  50.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0706791  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3748  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  27.96 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.668578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5187  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  30.95 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_50907  reductase of ferredoxin thioredoxin reductase  34.52 
 
 		 160 aa  44.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18254  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  31.71 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1734  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic chain  29.89 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.837813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1641  ferredoxin thioredoxin reductase, beta chain  28.57 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.872315  normal  0.552751 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2283  ferredoxin thioredoxin reductase, catalytic beta chain  31.65 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.119617 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4385  ferredoxin thioredoxin reductase subunit beta  28.57 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>