27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0502 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 		 172 aa  351  2.9999999999999997e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.21 
 
 		 163 aa  205  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2432  rubredoxin  53.94 
 
 		 167 aa  192  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000792123  normal  0.129833 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0831  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.41 
 
 		 171 aa  187  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.45968  normal  0.308889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2454  rubredoxin  57.79 
 
 		 157 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0927  putative ferredoxin-thioredoxin reductase,catalyticsubunit  56.21 
 
 		 167 aa  175  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.091769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.18 
 
 		 167 aa  174  6e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00592628  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0199  ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic subunit, putative/rubredoxin  52.05 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_187  rubredoxin-type iron-sulfur protein  50.29 
 
 		 168 aa  165  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000349376  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0077  hypothetical protein  60 
 
 		 116 aa  122  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0349  hypothetical protein  57.28 
 
 		 111 aa  121  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1407  hypothetical protein  52.21 
 
 		 119 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2967  hypothetical protein  57.58 
 
 		 110 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000688679  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2738  hypothetical protein  50.5 
 
 		 114 aa  111  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849161  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2100  hypothetical protein  48.54 
 
 		 114 aa  111  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.375211 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2934  hypothetical protein  52.48 
 
 		 114 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.180686 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0980  thioredoxin-related protein  41.18 
 
 		 95 aa  73.6  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.744067  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1842  hypothetical protein  42.5 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102769  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2203  thioredoxin-related protein  45.07 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  39.44 
 
 		 241 aa  67.8  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2384  hypothetical protein  37.04 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2920  hypothetical protein  34.15 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.927487  hitchhiker  0.000209703 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1252  hypothetical protein  41.79 
 
 		 96 aa  63.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.026708  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0305  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic subunit-like protein  31.71 
 
 		 582 aa  60.8  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0211  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  53.9  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  50 
 
 		 168 aa  45.1  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1374  rhodanese-like protein  30.85 
 
 		 245 aa  43.9  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0706791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>