47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0907 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 		 163 aa  329  9e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0831  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  59.17 
 
 		 171 aa  206  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.45968  normal  0.308889 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.21 
 
 		 172 aa  205  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2432  rubredoxin  57.49 
 
 		 167 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000792123  normal  0.129833 
 
 
-
 
NC_002936  DET0199  ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic subunit, putative/rubredoxin  57.86 
 
 		 168 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  61.29 
 
 		 167 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00592628  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2454  rubredoxin  61.29 
 
 		 157 aa  192  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_187  rubredoxin-type iron-sulfur protein  57.23 
 
 		 168 aa  187  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000349376  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0927  putative ferredoxin-thioredoxin reductase,catalyticsubunit  52.47 
 
 		 167 aa  177  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.091769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0077  hypothetical protein  56 
 
 		 116 aa  117  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2967  hypothetical protein  55 
 
 		 110 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000688679  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1407  hypothetical protein  51.96 
 
 		 119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.613858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0349  hypothetical protein  54.9 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2738  hypothetical protein  49 
 
 		 114 aa  105  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849161  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2100  hypothetical protein  43.93 
 
 		 114 aa  104  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.375211 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2934  hypothetical protein  48 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.180686 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1842  hypothetical protein  43.33 
 
 		 92 aa  80.9  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102769  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0980  thioredoxin-related protein  44 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.744067  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2920  hypothetical protein  36.36 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.927487  hitchhiker  0.000209703 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2384  hypothetical protein  38.55 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2203  thioredoxin-related protein  44.59 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0334  thioredoxin-related protein  38.67 
 
 		 241 aa  67  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.524659  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1252  hypothetical protein  42.03 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.026708  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0305  ferredoxin-thioredoxin reductase catalytic subunit-like protein  33.75 
 
 		 582 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0211  hypothetical protein  31.03 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  44.12 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  50 
 
 		 884 aa  45.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5187  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  28.57 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  53.12 
 
 		 216 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  48.57 
 
 		 168 aa  44.7  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0606  ferredoxin thioredoxin reductase beta chain  27.17 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  54.55 
 
 		 185 aa  44.3  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1529  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.67 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00138894  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  45.45 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  50 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  45.16 
 
 		 392 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3241  hypothetical protein  56.67 
 
 		 36 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000312443  hitchhiker  0.0015976 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  51.61 
 
 		 192 aa  41.6  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3816  rubrerythrin  51.72 
 
 		 180 aa  41.6  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477508  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  47.06 
 
 		 191 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0063  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.88 
 
 		 111 aa  41.2  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  37.78 
 
 		 878 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  41.94 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  37.78 
 
 		 878 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2460  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase or nitrite reductase  37.25 
 
 		 501 aa  40.8  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000440664  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  51.61 
 
 		 190 aa  40.8  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0588  rubrerythrin  51.72 
 
 		 181 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>