76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0588 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0588  rubrerythrin  100 
 
 		 181 aa  373  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4567  Rubrerythrin  81.22 
 
 		 181 aa  311  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.02567e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3505  rubrerythrin  79.44 
 
 		 180 aa  304  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000134331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2638  rubrerythrin  76.8 
 
 		 188 aa  292  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0681  rubredoxin/rubrerythrin  76.8 
 
 		 180 aa  292  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0099  rubrerythrin  76.8 
 
 		 180 aa  292  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0220347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2955  rubredoxin/rubrerythrin  76.8 
 
 		 180 aa  292  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00806345  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0077  rubredoxin/rubrerythrin  76.24 
 
 		 180 aa  291  4e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.165154  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0682  rubredoxin/rubrerythrin  76.8 
 
 		 180 aa  290  6e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0902  Rubrerythrin  77.35 
 
 		 181 aa  276  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197939  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0081  rubrerythrin  70 
 
 		 181 aa  273  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3816  rubrerythrin  65.75 
 
 		 180 aa  249  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477508  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0387  rubrerythrin  52.11 
 
 		 139 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.424409 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1879  rubrerythrin  53.33 
 
 		 140 aa  134  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000143668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0449  rubrerythrin  52.11 
 
 		 139 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1532  rubrerythrin  50.7 
 
 		 139 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0954  rubrerythrin  54.93 
 
 		 140 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0458  rubrerythrin  49.3 
 
 		 139 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.79007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15600  Rubrerythrin  47.52 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2476  rubrerythrin  48.23 
 
 		 140 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000982174  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1108  Rubrerythrin  49.26 
 
 		 143 aa  109  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.666656  normal  0.376082 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2434  rubrerythrin  44.44 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1596  hypothetical protein  40.98 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0063  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.78 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  29.63 
 
 		 392 aa  51.6  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  60 
 
 		 216 aa  51.2  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.16 
 
 		 520 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1529  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.33 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00138894  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  63.33 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  63.33 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  58.62 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3241  hypothetical protein  58.82 
 
 		 36 aa  48.5  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000312443  hitchhiker  0.0015976 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  51.43 
 
 		 216 aa  48.1  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  30.53 
 
 		 696 aa  47.8  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  58.62 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  37.66 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  58.62 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  58.62 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  30.08 
 
 		 696 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  58.62 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  37.66 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2117  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.56 
 
 		 111 aa  45.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  51.61 
 
 		 884 aa  46.2  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  62.5 
 
 		 172 aa  45.4  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  55.17 
 
 		 214 aa  45.1  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  56.67 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  60.61 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  36.36 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  25 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2460  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase or nitrite reductase  48.39 
 
 		 501 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000440664  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  31.5 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2454  rubredoxin  51.72 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  36.36 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  36.36 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  50 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2234  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000004842  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  35.71 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  35.06 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  43.28 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  32.38 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  55.17 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  35.09 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  29.13 
 
 		 221 aa  42.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  38.96 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  31.25 
 
 		 146 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  46.88 
 
 		 185 aa  42  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  50 
 
 		 179 aa  42  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  26.67 
 
 		 196 aa  42  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  28.24 
 
 		 144 aa  42  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  28.21 
 
 		 178 aa  42  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  27.12 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3043  bacterioferritin  35.09 
 
 		 159 aa  41.6  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0657083  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  36 
 
 		 166 aa  41.6  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  70 
 
 		 197 aa  41.6  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  55.56 
 
 		 190 aa  41.2  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  27.82 
 
 		 191 aa  41.2  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>