208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0453 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  100 
 
 
144 aa  296  9e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  85.21 
 
 
143 aa  253  5e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  68.31 
 
 
140 aa  201  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0899  Rubrerythrin  66.9 
 
 
144 aa  201  4e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  63.83 
 
 
146 aa  184  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  62.86 
 
 
146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  61.43 
 
 
140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  62.14 
 
 
140 aa  180  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  62.14 
 
 
140 aa  180  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  62.14 
 
 
140 aa  180  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  62.14 
 
 
140 aa  180  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  62.14 
 
 
140 aa  180  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  62.14 
 
 
140 aa  180  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  62.14 
 
 
140 aa  180  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  62.14 
 
 
140 aa  180  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  61.43 
 
 
139 aa  178  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  61.43 
 
 
139 aa  178  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  61.43 
 
 
139 aa  178  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  62.14 
 
 
140 aa  178  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  59.29 
 
 
140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  62.86 
 
 
140 aa  177  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  60.71 
 
 
140 aa  177  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  60.71 
 
 
140 aa  177  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  60.71 
 
 
140 aa  177  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  61.43 
 
 
140 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  62.04 
 
 
139 aa  177  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  60 
 
 
140 aa  176  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  60.71 
 
 
139 aa  176  9e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  60.14 
 
 
168 aa  174  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  59.42 
 
 
139 aa  173  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  60.14 
 
 
139 aa  172  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  60.87 
 
 
139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  57.86 
 
 
140 aa  169  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  58.57 
 
 
140 aa  168  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  58.7 
 
 
139 aa  166  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0059  rubrerythrin  53.33 
 
 
156 aa  147  7e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0465733  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  45.45 
 
 
179 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  43.06 
 
 
178 aa  113  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  45.45 
 
 
178 aa  110  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  42.66 
 
 
178 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  45.45 
 
 
178 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  41.96 
 
 
178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  40.41 
 
 
196 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  43.26 
 
 
179 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  43.57 
 
 
179 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  40.13 
 
 
197 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  41.26 
 
 
191 aa  105  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  41.96 
 
 
179 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  43.97 
 
 
179 aa  105  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  42.36 
 
 
191 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  45.65 
 
 
166 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  40 
 
 
192 aa  103  6e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  41.5 
 
 
191 aa  103  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  47.37 
 
 
172 aa  103  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  44.93 
 
 
166 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  43.38 
 
 
221 aa  103  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  44.93 
 
 
166 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  47.41 
 
 
166 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  40.44 
 
 
164 aa  102  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  41.48 
 
 
165 aa  100  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  44.29 
 
 
177 aa  100  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  38.36 
 
 
191 aa  100  8e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  42.03 
 
 
165 aa  99.8  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  39.04 
 
 
191 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  40.14 
 
 
191 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  36.88 
 
 
179 aa  99  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  39.58 
 
 
190 aa  98.6  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  41.04 
 
 
164 aa  99  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  39.07 
 
 
195 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  39.07 
 
 
195 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  39.71 
 
 
166 aa  99.4  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  43.07 
 
 
166 aa  98.6  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  41.48 
 
 
168 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  41.67 
 
 
180 aa  98.6  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  43.61 
 
 
190 aa  98.2  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  42.36 
 
 
192 aa  97.8  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  40 
 
 
165 aa  97.8  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  38.36 
 
 
192 aa  97.8  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  36.99 
 
 
191 aa  97.4  6e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  40.97 
 
 
190 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  40.74 
 
 
165 aa  97.1  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  39.04 
 
 
192 aa  97.1  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  43.85 
 
 
167 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  36.73 
 
 
191 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  38.26 
 
 
196 aa  95.5  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  38.89 
 
 
190 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  40.56 
 
 
191 aa  95.5  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  39.58 
 
 
194 aa  94.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  39.31 
 
 
191 aa  94  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  42.34 
 
 
166 aa  94.4  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  43.51 
 
 
164 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  41.91 
 
 
165 aa  93.6  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  36.88 
 
 
181 aa  93.6  7e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  41.84 
 
 
179 aa  93.6  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  38.36 
 
 
191 aa  93.6  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  38.89 
 
 
190 aa  93.2  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  41.43 
 
 
696 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  38.19 
 
 
194 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  40.43 
 
 
177 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  41.48 
 
 
168 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>