211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1538 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  100 
 
 		 178 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  100 
 
 		 178 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  49.72 
 
 		 178 aa  167  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  48 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  48.28 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  42.86 
 
 		 179 aa  157  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  41.18 
 
 		 190 aa  156  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  48 
 
 		 179 aa  156  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  43.02 
 
 		 178 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  42.86 
 
 		 191 aa  156  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  43.43 
 
 		 180 aa  153  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  40 
 
 		 197 aa  153  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  43.17 
 
 		 190 aa  152  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  41.27 
 
 		 191 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  41.86 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  40.43 
 
 		 191 aa  151  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  40.53 
 
 		 191 aa  149  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  42.29 
 
 		 179 aa  149  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  44.07 
 
 		 178 aa  148  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  40.72 
 
 		 195 aa  148  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  41.05 
 
 		 191 aa  148  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  43.43 
 
 		 179 aa  147  9e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  46.86 
 
 		 177 aa  147  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  39.89 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  41.8 
 
 		 191 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  39.68 
 
 		 191 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  40.21 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  41.3 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  39.47 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  41.38 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  40.21 
 
 		 195 aa  145  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  37.77 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  39.47 
 
 		 191 aa  144  5e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  40.23 
 
 		 178 aa  144  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  42.55 
 
 		 192 aa  144  9e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  39.27 
 
 		 196 aa  143  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  39.04 
 
 		 190 aa  143  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  38.62 
 
 		 191 aa  142  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  39.57 
 
 		 191 aa  142  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  42.77 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  43.6 
 
 		 177 aa  141  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  35.75 
 
 		 194 aa  140  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  40.53 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  41.05 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  38.25 
 
 		 188 aa  135  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  40.7 
 
 		 233 aa  134  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  37.84 
 
 		 190 aa  134  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  39.9 
 
 		 194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  40.46 
 
 		 696 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  38.95 
 
 		 392 aa  132  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  39.41 
 
 		 696 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  37.84 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  41.28 
 
 		 221 aa  128  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  34.92 
 
 		 191 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  38.92 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  40.45 
 
 		 216 aa  124  9e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  35.96 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  40.45 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  40.45 
 
 		 183 aa  121  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  40.45 
 
 		 183 aa  121  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  37.29 
 
 		 214 aa  120  7e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  40.45 
 
 		 215 aa  120  8e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  34.74 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  35.14 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  34.59 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  32.43 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  33.51 
 
 		 195 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  33.51 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  38.04 
 
 		 165 aa  102  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  32.74 
 
 		 172 aa  95.1  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  33.74 
 
 		 164 aa  94.7  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  37.65 
 
 		 163 aa  90.9  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  39.42 
 
 		 139 aa  90.5  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  39.71 
 
 		 168 aa  89.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  40.29 
 
 		 140 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  40.29 
 
 		 140 aa  87.8  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  40.29 
 
 		 140 aa  87.8  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  35.47 
 
 		 167 aa  87.8  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  40.29 
 
 		 140 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  40.29 
 
 		 140 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  40.29 
 
 		 140 aa  87.8  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  40.29 
 
 		 140 aa  87.8  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  40.29 
 
 		 140 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  36.31 
 
 		 164 aa  87.8  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  34.52 
 
 		 165 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  40.15 
 
 		 140 aa  87  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  38.85 
 
 		 140 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  38.85 
 
 		 140 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  40.46 
 
 		 139 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  38.85 
 
 		 140 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  35.85 
 
 		 165 aa  85.9  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  39.39 
 
 		 140 aa  85.9  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  40.15 
 
 		 140 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  33.93 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  31.95 
 
 		 164 aa  85.5  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  38.93 
 
 		 139 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  38.93 
 
 		 139 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  38.93 
 
 		 139 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  40.91 
 
 		 140 aa  84.7  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  37.14 
 
 		 140 aa  84.7  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>