198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4116 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  100 
 
 
140 aa  288  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  95 
 
 
140 aa  278  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  95 
 
 
140 aa  277  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  95 
 
 
140 aa  277  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  95 
 
 
140 aa  277  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  92.86 
 
 
140 aa  273  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  92.86 
 
 
140 aa  273  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  92.86 
 
 
140 aa  273  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  92.86 
 
 
140 aa  273  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  92.86 
 
 
140 aa  273  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  92.86 
 
 
140 aa  273  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  92.86 
 
 
140 aa  273  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  92.86 
 
 
140 aa  273  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  92.86 
 
 
140 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  92.14 
 
 
140 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  91.43 
 
 
140 aa  270  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  89.13 
 
 
168 aa  260  4.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  89.05 
 
 
139 aa  258  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  86.43 
 
 
140 aa  255  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  87.68 
 
 
139 aa  252  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  85.71 
 
 
140 aa  251  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  83.82 
 
 
139 aa  243  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  84.56 
 
 
139 aa  238  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  82.61 
 
 
139 aa  238  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  82.61 
 
 
140 aa  236  6.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  76.81 
 
 
139 aa  222  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  76.81 
 
 
139 aa  222  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  76.81 
 
 
139 aa  222  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  76.81 
 
 
139 aa  219  8e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  71.74 
 
 
140 aa  215  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  67.39 
 
 
146 aa  201  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  66.91 
 
 
146 aa  202  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0899  Rubrerythrin  65.69 
 
 
144 aa  178  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  62.86 
 
 
143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.585668 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  60 
 
 
144 aa  176  7e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0059  rubrerythrin  57.14 
 
 
156 aa  150  5e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0465733  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  52.17 
 
 
179 aa  125  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  46.38 
 
 
178 aa  122  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  50 
 
 
178 aa  122  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  50 
 
 
178 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  52.31 
 
 
167 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  52.27 
 
 
165 aa  120  7e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  48.15 
 
 
177 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  49.24 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  46.38 
 
 
178 aa  118  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  52.67 
 
 
164 aa  117  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  48.87 
 
 
168 aa  115  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  50.76 
 
 
165 aa  114  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  44.14 
 
 
191 aa  114  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  47.37 
 
 
168 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  45.77 
 
 
192 aa  113  7.999999999999999e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  49.62 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  47.48 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  45 
 
 
178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  46.32 
 
 
191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  45.39 
 
 
190 aa  111  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  47.33 
 
 
164 aa  111  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  45.71 
 
 
190 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  44.37 
 
 
191 aa  110  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  48.09 
 
 
168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  45.45 
 
 
191 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  44.85 
 
 
191 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  40.54 
 
 
197 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  43.36 
 
 
191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  41.96 
 
 
191 aa  107  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  47.69 
 
 
163 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  42.65 
 
 
179 aa  107  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  47.41 
 
 
179 aa  106  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  48.46 
 
 
165 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  42.86 
 
 
196 aa  106  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  48.46 
 
 
165 aa  105  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  43.97 
 
 
190 aa  105  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  45.11 
 
 
221 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  46.15 
 
 
166 aa  105  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  43.38 
 
 
191 aa  104  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  48.46 
 
 
165 aa  104  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  45.04 
 
 
172 aa  104  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  48.84 
 
 
164 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  43.36 
 
 
191 aa  103  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  44.29 
 
 
190 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  44.53 
 
 
191 aa  102  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  46.09 
 
 
179 aa  102  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  46.09 
 
 
179 aa  102  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  45 
 
 
196 aa  102  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  41.26 
 
 
191 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  44.68 
 
 
192 aa  101  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  44.36 
 
 
190 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  45.45 
 
 
166 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  42.54 
 
 
192 aa  100  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  46.15 
 
 
165 aa  100  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  44.62 
 
 
165 aa  100  6e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  45.38 
 
 
167 aa  100  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  42.86 
 
 
190 aa  100  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  49.28 
 
 
169 aa  99.4  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  43.88 
 
 
188 aa  99.8  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  44.7 
 
 
166 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  42.66 
 
 
191 aa  99.8  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  40.71 
 
 
192 aa  99  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1762  rubrerythrin  39.73 
 
 
157 aa  99  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.224353 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  44.7 
 
 
166 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>