215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2212 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  100 
 
 		 177 aa  360  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  70.45 
 
 		 178 aa  263  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  64.97 
 
 		 179 aa  243  9e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  66.67 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  60.85 
 
 		 191 aa  239  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  70.39 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  59.47 
 
 		 190 aa  234  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  67.05 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  58.95 
 
 		 190 aa  228  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  57.67 
 
 		 192 aa  227  5e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  57.14 
 
 		 191 aa  224  7e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  56.08 
 
 		 191 aa  220  8e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  60 
 
 		 197 aa  220  8e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  57.98 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  56.38 
 
 		 191 aa  216  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  57.98 
 
 		 191 aa  216  1e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  55.79 
 
 		 190 aa  213  9e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  56.32 
 
 		 190 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  60.57 
 
 		 178 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  57.67 
 
 		 192 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  53.97 
 
 		 191 aa  212  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  59.43 
 
 		 178 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  53.97 
 
 		 192 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  58.19 
 
 		 177 aa  211  5.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  54.19 
 
 		 179 aa  208  4e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  55.03 
 
 		 191 aa  208  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  59.06 
 
 		 178 aa  207  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  57.67 
 
 		 192 aa  207  8e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  52.63 
 
 		 190 aa  206  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  53.44 
 
 		 191 aa  204  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  54.75 
 
 		 179 aa  204  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  54.75 
 
 		 179 aa  204  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  55.79 
 
 		 190 aa  204  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  55.31 
 
 		 179 aa  203  9e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  54.92 
 
 		 195 aa  203  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  55.03 
 
 		 191 aa  202  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  52.66 
 
 		 191 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  55.49 
 
 		 221 aa  201  3e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  53.37 
 
 		 195 aa  200  9e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  53.72 
 
 		 188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  55.62 
 
 		 180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  54.07 
 
 		 233 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  55.87 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  51.85 
 
 		 191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  53.06 
 
 		 196 aa  193  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  52.6 
 
 		 392 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  50.81 
 
 		 191 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  52.3 
 
 		 696 aa  183  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  51.15 
 
 		 696 aa  182  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  50.84 
 
 		 181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  47.87 
 
 		 191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  47.4 
 
 		 194 aa  178  4e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  47.4 
 
 		 194 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  48.47 
 
 		 196 aa  177  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  46.67 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  45.83 
 
 		 194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  45.31 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  44.27 
 
 		 195 aa  164  8e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  46.86 
 
 		 178 aa  160  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  46.86 
 
 		 178 aa  160  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  42.33 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  47.65 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  46.43 
 
 		 214 aa  143  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  46.15 
 
 		 183 aa  140  9e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  46.15 
 
 		 183 aa  140  9e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  46.15 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  46.75 
 
 		 215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  42.01 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  44.97 
 
 		 216 aa  137  8.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  43.29 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  40.72 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  48.15 
 
 		 140 aa  114  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  46.72 
 
 		 139 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  41.61 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  38.65 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  46.72 
 
 		 139 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  46.67 
 
 		 139 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  46.67 
 
 		 139 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  46.67 
 
 		 139 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  47.06 
 
 		 139 aa  111  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  43.88 
 
 		 139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  39.49 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  39.26 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  45.38 
 
 		 139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  38.65 
 
 		 165 aa  107  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  44.44 
 
 		 140 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  44.53 
 
 		 139 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  42.96 
 
 		 140 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  44.44 
 
 		 140 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  41.77 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  43.07 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  42.96 
 
 		 140 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  42.96 
 
 		 140 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  42.96 
 
 		 140 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  43.7 
 
 		 140 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  43.38 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  44.2 
 
 		 140 aa  104  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  42.22 
 
 		 140 aa  104  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  42.22 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  42.22 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>