198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0633 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  100 
 
 
191 aa  396  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  65.45 
 
 
191 aa  264  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  65.97 
 
 
191 aa  263  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  62.7 
 
 
191 aa  245  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  61.26 
 
 
191 aa  244  6e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  62.43 
 
 
190 aa  242  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  63.24 
 
 
191 aa  241  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  59.69 
 
 
191 aa  239  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  60.11 
 
 
190 aa  238  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  62.9 
 
 
192 aa  235  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  59.47 
 
 
192 aa  234  7e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  57.07 
 
 
191 aa  230  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  58.92 
 
 
191 aa  229  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  55.5 
 
 
191 aa  228  4e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  55.26 
 
 
192 aa  228  6e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  55.5 
 
 
191 aa  226  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  56.61 
 
 
190 aa  225  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  58.2 
 
 
190 aa  224  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  58.2 
 
 
192 aa  220  9e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  55.5 
 
 
191 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  56.04 
 
 
190 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  53.33 
 
 
190 aa  209  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  53.85 
 
 
188 aa  207  6e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  52.88 
 
 
191 aa  206  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  52.38 
 
 
195 aa  201  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  51.85 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  50.27 
 
 
191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  51.87 
 
 
178 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  50 
 
 
197 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  53.55 
 
 
179 aa  184  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  50.81 
 
 
177 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  45.5 
 
 
179 aa  175  4e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  45.9 
 
 
179 aa  174  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  45.9 
 
 
179 aa  174  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  48.11 
 
 
178 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  48.11 
 
 
178 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  43.85 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  44.32 
 
 
179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  48.11 
 
 
178 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  46.45 
 
 
177 aa  170  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  47.03 
 
 
180 aa  170  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  47.25 
 
 
179 aa  169  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  46.45 
 
 
179 aa  167  8e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  43.81 
 
 
196 aa  167  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  45.95 
 
 
178 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  47.22 
 
 
221 aa  165  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  46.41 
 
 
696 aa  164  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  42.05 
 
 
196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  44.75 
 
 
696 aa  161  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  41.27 
 
 
195 aa  161  7e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  40.31 
 
 
194 aa  158  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  41.94 
 
 
194 aa  158  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  43.09 
 
 
194 aa  157  7e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  43.09 
 
 
194 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  42.55 
 
 
194 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  40.56 
 
 
392 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  42.55 
 
 
181 aa  149  4e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  38.22 
 
 
194 aa  147  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  38.55 
 
 
233 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  37.43 
 
 
215 aa  127  9.000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  34.92 
 
 
178 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  34.92 
 
 
178 aa  125  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  37.77 
 
 
183 aa  124  6e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  37.77 
 
 
183 aa  124  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  37.77 
 
 
183 aa  124  7e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  38.89 
 
 
216 aa  122  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  36.7 
 
 
215 aa  121  5e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  37.5 
 
 
214 aa  118  7e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  44.44 
 
 
139 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  44.44 
 
 
139 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  44.44 
 
 
139 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  34.64 
 
 
164 aa  98.6  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  34.64 
 
 
166 aa  98.2  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  43.8 
 
 
139 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  43.88 
 
 
140 aa  96.3  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  45.59 
 
 
139 aa  95.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  41.96 
 
 
139 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  41.61 
 
 
140 aa  94  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  32.77 
 
 
166 aa  93.2  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  43.38 
 
 
168 aa  93.2  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  33.15 
 
 
168 aa  91.7  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  41.3 
 
 
140 aa  91.3  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  33.7 
 
 
165 aa  90.5  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  42.45 
 
 
140 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  42.45 
 
 
140 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  42.45 
 
 
140 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  34.08 
 
 
165 aa  90.5  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  43.38 
 
 
139 aa  90.1  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  40.28 
 
 
140 aa  89.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  44.12 
 
 
139 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  41.73 
 
 
140 aa  89.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  41.73 
 
 
140 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  41.73 
 
 
140 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  41.73 
 
 
140 aa  89.4  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  40.29 
 
 
140 aa  89.4  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  41.73 
 
 
140 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  41.73 
 
 
140 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  41.73 
 
 
140 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  41.73 
 
 
140 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  41.73 
 
 
140 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>