209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1320 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  100 
 
 
165 aa  337  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  79.64 
 
 
164 aa  259  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  79.39 
 
 
164 aa  259  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  70.3 
 
 
167 aa  227  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  66.46 
 
 
164 aa  207  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  62.42 
 
 
164 aa  203  8e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  59.26 
 
 
172 aa  194  3e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  60 
 
 
168 aa  187  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  60.61 
 
 
168 aa  186  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  56.89 
 
 
166 aa  185  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  56.89 
 
 
166 aa  184  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  56.89 
 
 
166 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  59.17 
 
 
163 aa  183  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  60.25 
 
 
164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  56.55 
 
 
166 aa  180  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  58.54 
 
 
168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  57.14 
 
 
165 aa  177  4.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  56.89 
 
 
165 aa  177  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  57.58 
 
 
168 aa  176  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  55.09 
 
 
165 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  61.11 
 
 
163 aa  167  8e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  53.89 
 
 
165 aa  166  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  55.15 
 
 
165 aa  165  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  59.15 
 
 
169 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  54.55 
 
 
165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  55.76 
 
 
166 aa  164  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  53.61 
 
 
166 aa  160  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  53.61 
 
 
166 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  51.83 
 
 
166 aa  157  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  53.29 
 
 
166 aa  156  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  53.21 
 
 
158 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  52.73 
 
 
166 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  50.61 
 
 
166 aa  154  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  53.05 
 
 
166 aa  154  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  52.1 
 
 
166 aa  153  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  51.22 
 
 
165 aa  153  8e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  50.6 
 
 
166 aa  149  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  48.5 
 
 
166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  48.5 
 
 
166 aa  143  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  50.61 
 
 
173 aa  141  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  48.19 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  47.56 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  44 
 
 
182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  46.34 
 
 
166 aa  134  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  47.9 
 
 
168 aa  134  5e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  43.18 
 
 
185 aa  133  9e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  46.58 
 
 
167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  44.72 
 
 
167 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  45.71 
 
 
182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  44.75 
 
 
182 aa  125  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  46.95 
 
 
170 aa  123  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  42.86 
 
 
169 aa  123  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  46.95 
 
 
170 aa  123  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  42.94 
 
 
185 aa  121  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  44.58 
 
 
169 aa  121  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  44.44 
 
 
170 aa  120  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  43.64 
 
 
168 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  41.34 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  45.91 
 
 
178 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  45.28 
 
 
178 aa  117  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  50.76 
 
 
140 aa  117  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  50 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  50.75 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  41.38 
 
 
184 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  50.76 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  50 
 
 
140 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  50 
 
 
140 aa  114  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  50 
 
 
140 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  39.44 
 
 
184 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  49.24 
 
 
139 aa  114  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  50 
 
 
140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  50.76 
 
 
140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  50.76 
 
 
140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  50.76 
 
 
140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  40.22 
 
 
184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  49.24 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  49.24 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  49.24 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  50.76 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  49.24 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  49.24 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  49.24 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  49.24 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  49.24 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  50 
 
 
140 aa  111  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  50 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  38.86 
 
 
202 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  48.48 
 
 
139 aa  111  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  38.86 
 
 
228 aa  111  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  38.86 
 
 
263 aa  111  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  39.33 
 
 
190 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  36.78 
 
 
182 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  46.04 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  37.87 
 
 
178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  47.76 
 
 
139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  43.04 
 
 
178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  50 
 
 
139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  40.61 
 
 
166 aa  108  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  47.37 
 
 
139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  50 
 
 
139 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>