197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1185 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  100 
 
 
164 aa  345  2e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  58.97 
 
 
165 aa  202  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  46.47 
 
 
179 aa  148  4e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  45.51 
 
 
179 aa  147  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  42.33 
 
 
178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  42.35 
 
 
179 aa  144  8.000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  42.94 
 
 
179 aa  143  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  40 
 
 
179 aa  136  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  42.26 
 
 
180 aa  135  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  41.32 
 
 
221 aa  134  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  41.88 
 
 
392 aa  133  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  41.1 
 
 
178 aa  132  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  41.57 
 
 
178 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  44.12 
 
 
179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  44.12 
 
 
179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  41.98 
 
 
696 aa  131  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  41.21 
 
 
696 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  42.01 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  42.17 
 
 
178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  42.17 
 
 
178 aa  127  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  41.32 
 
 
177 aa  127  8.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  38.92 
 
 
190 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  37.99 
 
 
191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  37.65 
 
 
181 aa  125  3e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  37.02 
 
 
190 aa  122  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  36.67 
 
 
192 aa  122  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  35.75 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  36.46 
 
 
190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  36.87 
 
 
191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  37.22 
 
 
191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  36.46 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  40.83 
 
 
179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  35.16 
 
 
196 aa  111  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  34.81 
 
 
190 aa  110  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  35.2 
 
 
191 aa  110  8.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  33.33 
 
 
191 aa  110  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  36.22 
 
 
197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  33.9 
 
 
191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  35.59 
 
 
191 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  34.08 
 
 
191 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  37.65 
 
 
233 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  33.87 
 
 
196 aa  105  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  34.64 
 
 
191 aa  105  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  35.76 
 
 
216 aa  105  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  36.31 
 
 
192 aa  104  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  33.91 
 
 
188 aa  104  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  35.36 
 
 
194 aa  104  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  31.84 
 
 
192 aa  103  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  33.71 
 
 
191 aa  103  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  36.14 
 
 
183 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  32.4 
 
 
192 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  36.14 
 
 
183 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  36.14 
 
 
183 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  44.44 
 
 
139 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  32.76 
 
 
191 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  33.7 
 
 
190 aa  102  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  34.34 
 
 
215 aa  100  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  34.15 
 
 
215 aa  99.8  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  34.43 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  33.88 
 
 
194 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  41.48 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  34.64 
 
 
191 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  33.33 
 
 
194 aa  98.2  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  34.24 
 
 
194 aa  97.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  41.79 
 
 
140 aa  97.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  33.88 
 
 
195 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  42.96 
 
 
139 aa  97.1  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  32.93 
 
 
214 aa  97.1  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  33.88 
 
 
195 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  41.04 
 
 
140 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  40 
 
 
168 aa  95.5  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  41.67 
 
 
140 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  41.04 
 
 
140 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  33.14 
 
 
191 aa  94.7  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  33.74 
 
 
178 aa  94.7  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  33.74 
 
 
178 aa  94.7  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  33.11 
 
 
165 aa  94.7  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  42.22 
 
 
139 aa  94.4  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  38.52 
 
 
139 aa  94.4  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  40.3 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  40.3 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  40.3 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  40.91 
 
 
140 aa  92.8  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  39.55 
 
 
140 aa  92.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  33.7 
 
 
195 aa  92  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  39.55 
 
 
140 aa  91.7  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  40.6 
 
 
140 aa  91.3  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  38.81 
 
 
140 aa  90.9  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  35.29 
 
 
164 aa  90.5  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  38.06 
 
 
140 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  38.06 
 
 
140 aa  90.5  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  38.06 
 
 
140 aa  90.5  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  38.06 
 
 
140 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  38.06 
 
 
140 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  38.06 
 
 
140 aa  90.5  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  38.06 
 
 
140 aa  90.5  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  38.06 
 
 
140 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  40.74 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  35.19 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  39.85 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>