207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0999 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  373  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  66.29 
 
 
179 aa  248  4e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  66.67 
 
 
179 aa  241  5e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  65 
 
 
179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  63.28 
 
 
179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  61.58 
 
 
179 aa  219  9.999999999999999e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  62.22 
 
 
178 aa  218  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  61.11 
 
 
178 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  59.2 
 
 
181 aa  211  2.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  61.11 
 
 
178 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  57.78 
 
 
178 aa  208  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  58.96 
 
 
179 aa  208  3e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  58.38 
 
 
179 aa  207  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  59.66 
 
 
696 aa  203  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  53.97 
 
 
190 aa  202  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  53.4 
 
 
191 aa  202  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  52.88 
 
 
191 aa  202  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  58.29 
 
 
392 aa  202  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  58.52 
 
 
696 aa  201  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  54.45 
 
 
191 aa  201  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  48.69 
 
 
191 aa  200  8e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  56.18 
 
 
179 aa  199  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  53.44 
 
 
192 aa  197  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  51.83 
 
 
191 aa  197  6e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  50.26 
 
 
191 aa  197  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  51.31 
 
 
191 aa  197  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  55.43 
 
 
178 aa  196  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  55.56 
 
 
192 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  50.26 
 
 
190 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  51.27 
 
 
197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  55.43 
 
 
221 aa  195  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  51.32 
 
 
190 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  51.32 
 
 
192 aa  194  5.000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  51.6 
 
 
190 aa  194  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  51.61 
 
 
191 aa  192  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  49.74 
 
 
191 aa  191  7e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  55.62 
 
 
177 aa  189  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  49.74 
 
 
192 aa  189  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  49.74 
 
 
191 aa  188  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  48.97 
 
 
196 aa  186  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  51.83 
 
 
191 aa  186  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  53.37 
 
 
177 aa  185  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  50.53 
 
 
190 aa  184  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  49.47 
 
 
188 aa  182  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  49.46 
 
 
190 aa  180  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  49.74 
 
 
195 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  46.07 
 
 
191 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  48.72 
 
 
195 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  47.28 
 
 
191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  47.03 
 
 
191 aa  170  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  46.15 
 
 
196 aa  159  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  45.7 
 
 
194 aa  156  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  43.62 
 
 
194 aa  155  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  40.84 
 
 
194 aa  154  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  43.43 
 
 
178 aa  153  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  43.43 
 
 
178 aa  153  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  43.23 
 
 
194 aa  148  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  44.09 
 
 
194 aa  148  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  43.79 
 
 
233 aa  147  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  43.01 
 
 
194 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  44.97 
 
 
215 aa  140  7e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  46.75 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  40.96 
 
 
195 aa  138  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  42.26 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  44.38 
 
 
215 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  45.24 
 
 
214 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  43.79 
 
 
183 aa  130  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  43.79 
 
 
183 aa  130  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  43.79 
 
 
183 aa  130  9e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  41.57 
 
 
165 aa  122  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  40.62 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  37.13 
 
 
168 aa  105  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  46.38 
 
 
139 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  44.93 
 
 
140 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  44.93 
 
 
140 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  44.93 
 
 
140 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  44.93 
 
 
140 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  44.93 
 
 
140 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  44.93 
 
 
140 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  44.93 
 
 
140 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  44.93 
 
 
140 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  45.65 
 
 
140 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  37.58 
 
 
165 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  43.48 
 
 
139 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  45.93 
 
 
140 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  39.76 
 
 
167 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  43.48 
 
 
139 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  43.48 
 
 
139 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  40.59 
 
 
164 aa  99  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  45.19 
 
 
140 aa  98.6  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  37.58 
 
 
166 aa  98.6  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  44.93 
 
 
140 aa  98.6  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  41.67 
 
 
144 aa  98.6  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  43.48 
 
 
140 aa  98.6  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  40.51 
 
 
167 aa  98.2  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  43.48 
 
 
140 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  43.48 
 
 
140 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  43.48 
 
 
140 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  37.42 
 
 
165 aa  97.8  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  42.54 
 
 
139 aa  97.8  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>