224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0163 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  100 
 
 
178 aa  361  3e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  68.72 
 
 
179 aa  254  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  64.8 
 
 
179 aa  250  9.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  64.61 
 
 
178 aa  244  4e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  62.3 
 
 
191 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  59.69 
 
 
191 aa  237  6.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  62.92 
 
 
179 aa  236  2e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  61.26 
 
 
191 aa  236  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  61.8 
 
 
178 aa  233  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  59.9 
 
 
197 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  62.92 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  67.05 
 
 
177 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  60.67 
 
 
178 aa  231  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  63.58 
 
 
221 aa  231  5e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  60.11 
 
 
178 aa  230  8.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  67.42 
 
 
179 aa  230  9e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  59.26 
 
 
190 aa  229  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  62.43 
 
 
192 aa  228  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  58.73 
 
 
190 aa  226  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  62.22 
 
 
180 aa  226  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  59.16 
 
 
191 aa  225  3e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  60.32 
 
 
190 aa  224  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  62.5 
 
 
177 aa  223  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  57.59 
 
 
191 aa  221  6e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  56.54 
 
 
191 aa  219  9.999999999999999e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  56.84 
 
 
192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  57.07 
 
 
191 aa  218  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  56.32 
 
 
192 aa  218  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  56.61 
 
 
190 aa  218  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  59.77 
 
 
696 aa  216  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  59.77 
 
 
696 aa  214  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  57.98 
 
 
188 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  56.99 
 
 
190 aa  213  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  57.23 
 
 
392 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  55.85 
 
 
191 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  59.32 
 
 
179 aa  211  2.9999999999999995e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  56.02 
 
 
191 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  53.4 
 
 
191 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  56.18 
 
 
179 aa  209  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  58.99 
 
 
181 aa  209  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  51.83 
 
 
191 aa  209  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  54.87 
 
 
195 aa  207  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  55.62 
 
 
179 aa  207  6e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  52.63 
 
 
192 aa  207  7e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  54.36 
 
 
195 aa  206  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  54.64 
 
 
196 aa  204  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  54.79 
 
 
190 aa  204  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  50.79 
 
 
191 aa  197  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  50.54 
 
 
191 aa  190  8e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  54.12 
 
 
233 aa  190  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  53.09 
 
 
196 aa  188  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  48.11 
 
 
191 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  46.39 
 
 
194 aa  174  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  45.83 
 
 
194 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  45.31 
 
 
194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  49.72 
 
 
178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  45.83 
 
 
194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  49.72 
 
 
178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  43.98 
 
 
194 aa  170  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  47.15 
 
 
195 aa  168  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  45.31 
 
 
194 aa  168  4e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  43.56 
 
 
164 aa  150  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  46.33 
 
 
215 aa  149  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  49.08 
 
 
165 aa  147  6e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  44.97 
 
 
216 aa  136  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  44.07 
 
 
183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  44.07 
 
 
183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  44.07 
 
 
183 aa  134  8e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  42.61 
 
 
214 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  44.07 
 
 
215 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  50 
 
 
140 aa  127  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  44.79 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  43.64 
 
 
165 aa  124  5e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  42.94 
 
 
165 aa  121  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  46.38 
 
 
140 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  47.83 
 
 
140 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  45.65 
 
 
140 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  40.85 
 
 
165 aa  117  6e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  46.38 
 
 
140 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  46.38 
 
 
140 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  46.38 
 
 
140 aa  117  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  46.38 
 
 
140 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  46.38 
 
 
140 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  46.38 
 
 
140 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  46.38 
 
 
140 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  46.38 
 
 
140 aa  117  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  47.37 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  47.1 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  47.1 
 
 
139 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  47.1 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  47.1 
 
 
140 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  47.1 
 
 
140 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  47.1 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  39.76 
 
 
165 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  45.65 
 
 
140 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  45.65 
 
 
140 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  45.65 
 
 
140 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  45.93 
 
 
168 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  45.65 
 
 
140 aa  115  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  44.59 
 
 
167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>