206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3282 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  100 
 
 
166 aa  337  5e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  60.24 
 
 
166 aa  217  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  59.04 
 
 
166 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  60 
 
 
166 aa  210  5.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  61.82 
 
 
165 aa  209  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  61.21 
 
 
165 aa  207  7e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  59.88 
 
 
165 aa  201  3e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  59.04 
 
 
166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  59.26 
 
 
166 aa  192  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  55.56 
 
 
166 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  54.94 
 
 
167 aa  186  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  55.83 
 
 
168 aa  184  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  57.76 
 
 
168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  54.66 
 
 
166 aa  180  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  55.9 
 
 
168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  51.52 
 
 
166 aa  177  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  52.73 
 
 
166 aa  177  8e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  53.33 
 
 
166 aa  175  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  56.6 
 
 
172 aa  176  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  53.33 
 
 
166 aa  174  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  51.85 
 
 
166 aa  174  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  51.81 
 
 
165 aa  174  7e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  52.12 
 
 
166 aa  174  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  51.52 
 
 
166 aa  173  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  52.12 
 
 
166 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  53.9 
 
 
158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  52.47 
 
 
173 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  53.89 
 
 
164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  50 
 
 
165 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  50.31 
 
 
168 aa  169  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  53.85 
 
 
164 aa  168  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  51.52 
 
 
166 aa  169  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  50 
 
 
165 aa  167  4e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  55.84 
 
 
167 aa  167  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  49.38 
 
 
165 aa  166  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  48.77 
 
 
168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  53.9 
 
 
164 aa  164  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  51.55 
 
 
164 aa  163  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  56.17 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  49.09 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  53.99 
 
 
164 aa  162  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  52.76 
 
 
163 aa  159  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  50.61 
 
 
165 aa  154  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  46.01 
 
 
167 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  40.8 
 
 
185 aa  147  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  41.95 
 
 
184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  41.81 
 
 
182 aa  143  8.000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  45.06 
 
 
166 aa  143  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  41.48 
 
 
185 aa  138  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  41.98 
 
 
169 aa  137  6e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  40.78 
 
 
182 aa  137  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  40 
 
 
184 aa  137  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  40.8 
 
 
184 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  37.36 
 
 
182 aa  134  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  42.24 
 
 
167 aa  134  5e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  43.87 
 
 
170 aa  133  9e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  43.87 
 
 
170 aa  133  9e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  41.61 
 
 
168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  40.23 
 
 
184 aa  128  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  39.13 
 
 
169 aa  127  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  44.51 
 
 
228 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  42.58 
 
 
170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  39.55 
 
 
202 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  43.82 
 
 
182 aa  117  7.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  38.42 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  47.06 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  42.04 
 
 
221 aa  115  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  40.25 
 
 
181 aa  114  6e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  41.77 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  41.67 
 
 
177 aa  112  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  40.76 
 
 
233 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  41.77 
 
 
179 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  38.42 
 
 
202 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  35.59 
 
 
263 aa  109  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  39.1 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  40.13 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  42.31 
 
 
392 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  40.62 
 
 
180 aa  108  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  40.38 
 
 
178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  46.15 
 
 
140 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  46.15 
 
 
140 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  46.15 
 
 
140 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  40.38 
 
 
178 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  37.82 
 
 
178 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  45.38 
 
 
140 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  41.1 
 
 
167 aa  106  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  46.15 
 
 
140 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  44.7 
 
 
140 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  45.38 
 
 
140 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  45.38 
 
 
140 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  45.38 
 
 
140 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  39.64 
 
 
216 aa  105  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  46.15 
 
 
140 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  36.09 
 
 
190 aa  103  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  45.38 
 
 
139 aa  103  9e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  46.21 
 
 
146 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  37.74 
 
 
179 aa  103  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1537  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  33.63 
 
 
237 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0402296  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  37.93 
 
 
191 aa  103  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  46.15 
 
 
139 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>