222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2235 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  100 
 
 
392 aa  817    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  58.13 
 
 
696 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  59.17 
 
 
696 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  61.99 
 
 
221 aa  281  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  59.77 
 
 
179 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  59.77 
 
 
179 aa  216  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  59.43 
 
 
179 aa  214  1.9999999999999998e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  57.23 
 
 
178 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  56.65 
 
 
178 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  54.17 
 
 
178 aa  202  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  58.29 
 
 
180 aa  202  8e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  57.23 
 
 
178 aa  202  9e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  51.61 
 
 
192 aa  196  4.0000000000000005e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  52.57 
 
 
179 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  52.57 
 
 
179 aa  194  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  53.18 
 
 
177 aa  192  9e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  51.61 
 
 
188 aa  191  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  54.12 
 
 
179 aa  189  8e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  54.12 
 
 
179 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  48.92 
 
 
191 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  49.46 
 
 
190 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  50.27 
 
 
191 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  52.54 
 
 
181 aa  181  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  48.39 
 
 
191 aa  181  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  49.71 
 
 
178 aa  179  8e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  48.92 
 
 
190 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  48.92 
 
 
190 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  46.24 
 
 
190 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  49.46 
 
 
191 aa  176  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  46.28 
 
 
190 aa  176  9e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  48.39 
 
 
191 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  46.77 
 
 
191 aa  175  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  52.6 
 
 
177 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  46.77 
 
 
191 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  47.31 
 
 
192 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  52.57 
 
 
179 aa  171  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  45.31 
 
 
197 aa  171  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  48.39 
 
 
192 aa  168  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  45.16 
 
 
192 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  45.83 
 
 
196 aa  164  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  46.24 
 
 
191 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  46.77 
 
 
190 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  43.01 
 
 
191 aa  161  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  43.01 
 
 
191 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  43.75 
 
 
194 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  44.27 
 
 
194 aa  157  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  43.23 
 
 
194 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  43.68 
 
 
195 aa  155  8e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  43.65 
 
 
191 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  43.16 
 
 
195 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  42.19 
 
 
194 aa  152  7e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  43.92 
 
 
195 aa  150  3e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  49.7 
 
 
215 aa  149  7e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  40.56 
 
 
191 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  42.13 
 
 
216 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  43.23 
 
 
196 aa  146  5e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  37.63 
 
 
191 aa  144  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  47.34 
 
 
183 aa  143  5e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  47.34 
 
 
183 aa  143  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  39.04 
 
 
194 aa  143  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  47.34 
 
 
183 aa  143  6e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  39.9 
 
 
233 aa  143  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  39.38 
 
 
194 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  40.96 
 
 
191 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  45.03 
 
 
215 aa  140  3e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  44.64 
 
 
214 aa  136  6.0000000000000005e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  41.88 
 
 
164 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  38.95 
 
 
178 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  38.95 
 
 
178 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  40.88 
 
 
165 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  40.49 
 
 
165 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  39.63 
 
 
165 aa  113  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  42.07 
 
 
165 aa  113  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  41.46 
 
 
167 aa  113  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  39.49 
 
 
172 aa  112  9e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  38.41 
 
 
166 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  38.79 
 
 
165 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  42.31 
 
 
166 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  39.26 
 
 
166 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  40.36 
 
 
168 aa  106  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  40.85 
 
 
165 aa  106  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  39.39 
 
 
165 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  39.52 
 
 
168 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  39.29 
 
 
165 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  38.69 
 
 
163 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  37.42 
 
 
166 aa  103  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  39.02 
 
 
168 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  37.35 
 
 
166 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  39.1 
 
 
167 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  39.88 
 
 
168 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  36.2 
 
 
166 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  45.11 
 
 
139 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  39.39 
 
 
164 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  38.18 
 
 
164 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  40.24 
 
 
166 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  39.64 
 
 
166 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  40.24 
 
 
166 aa  99.8  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  40.24 
 
 
166 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  37.42 
 
 
166 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  37.42 
 
 
166 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>