207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1205 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  100 
 
 		 192 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  78.65 
 
 		 192 aa  316  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  78.19 
 
 		 191 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  76.72 
 
 		 190 aa  300  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  74.6 
 
 		 190 aa  299  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  75.26 
 
 		 191 aa  296  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  74.07 
 
 		 191 aa  288  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  71.96 
 
 		 190 aa  285  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  71.28 
 
 		 191 aa  281  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  68.95 
 
 		 191 aa  281  6.000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  67.2 
 
 		 191 aa  275  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  67.72 
 
 		 191 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  66.15 
 
 		 192 aa  275  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  66.14 
 
 		 191 aa  261  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  63.02 
 
 		 192 aa  260  6.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  65.08 
 
 		 191 aa  255  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  64.02 
 
 		 190 aa  255  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  63.64 
 
 		 191 aa  244  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  63.3 
 
 		 191 aa  242  3e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  59.68 
 
 		 190 aa  239  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  58.51 
 
 		 190 aa  230  8.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  57.67 
 
 		 191 aa  229  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  58.2 
 
 		 191 aa  228  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  56.12 
 
 		 197 aa  227  9e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  62.43 
 
 		 178 aa  223  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  55.03 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  55.03 
 
 		 191 aa  221  4.9999999999999996e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  54.64 
 
 		 196 aa  220  8e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  56.91 
 
 		 188 aa  219  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  54.92 
 
 		 195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  54.5 
 
 		 179 aa  218  5e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  53.89 
 
 		 195 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  57.45 
 
 		 179 aa  214  8e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  55.56 
 
 		 180 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  55.32 
 
 		 178 aa  209  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  53.19 
 
 		 179 aa  208  3e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  57.67 
 
 		 177 aa  208  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  54.35 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  52.97 
 
 		 179 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  52.97 
 
 		 179 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  52.38 
 
 		 179 aa  205  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  54.26 
 
 		 178 aa  204  9e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  52.13 
 
 		 178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  51.32 
 
 		 179 aa  197  6e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  52.04 
 
 		 196 aa  193  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  50.79 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  50.54 
 
 		 181 aa  182  4.0000000000000006e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  49.46 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  48.66 
 
 		 696 aa  178  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  48.39 
 
 		 392 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  48.13 
 
 		 696 aa  177  7e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  47.42 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  47.42 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  46.63 
 
 		 194 aa  174  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  46.52 
 
 		 194 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  47.34 
 
 		 194 aa  171  9e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  43.39 
 
 		 195 aa  168  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  45.36 
 
 		 233 aa  168  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  42.55 
 
 		 178 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  42.55 
 
 		 178 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  39.47 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  42.62 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  39.78 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  38.17 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  38.46 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  38.17 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  39.25 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  47.48 
 
 		 140 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  38.17 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  45.77 
 
 		 139 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  47.18 
 
 		 139 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  36.31 
 
 		 164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0899  Rubrerythrin  46.26 
 
 		 144 aa  112  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  46.81 
 
 		 140 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  38.07 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  45.39 
 
 		 140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  45.39 
 
 		 140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  45.32 
 
 		 139 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  45.39 
 
 		 140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  45.39 
 
 		 140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  45.39 
 
 		 140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  45.39 
 
 		 140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  45.39 
 
 		 140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  45.39 
 
 		 140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  44.06 
 
 		 139 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  46.1 
 
 		 139 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  44.68 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  46.1 
 
 		 139 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  46.1 
 
 		 139 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  44.68 
 
 		 140 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  44.68 
 
 		 140 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  44.68 
 
 		 140 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  44.37 
 
 		 140 aa  108  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  43.97 
 
 		 168 aa  108  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  43.97 
 
 		 140 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  34.64 
 
 		 165 aa  108  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  43.36 
 
 		 146 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  43.97 
 
 		 146 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  45.39 
 
 		 140 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  42.96 
 
 		 143 aa  107  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.585668 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>