200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2098 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  100 
 
 		 168 aa  349  8e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  94.96 
 
 		 139 aa  278  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  89.86 
 
 		 140 aa  262  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  89.13 
 
 		 140 aa  260  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  87.68 
 
 		 140 aa  258  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  87.68 
 
 		 140 aa  258  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  87.68 
 
 		 140 aa  258  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  87.68 
 
 		 140 aa  258  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  87.68 
 
 		 140 aa  258  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  87.68 
 
 		 140 aa  258  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  87.68 
 
 		 140 aa  258  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  87.68 
 
 		 140 aa  258  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  88.41 
 
 		 140 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  88.41 
 
 		 140 aa  258  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  88.41 
 
 		 140 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  88.41 
 
 		 140 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  87.68 
 
 		 140 aa  257  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  85.51 
 
 		 140 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  84.17 
 
 		 139 aa  251  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  84.67 
 
 		 139 aa  248  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  84.67 
 
 		 140 aa  244  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  86.86 
 
 		 140 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  82.73 
 
 		 139 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  82.96 
 
 		 140 aa  236  9e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  80.29 
 
 		 139 aa  233  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  79.41 
 
 		 139 aa  224  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  79.41 
 
 		 139 aa  224  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  79.41 
 
 		 139 aa  224  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  76.47 
 
 		 139 aa  218  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  74.26 
 
 		 140 aa  216  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  69.34 
 
 		 146 aa  208  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  69.85 
 
 		 146 aa  207  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0899  Rubrerythrin  63.5 
 
 		 144 aa  174  4e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  60.14 
 
 		 144 aa  174  7e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  62.04 
 
 		 143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0059  rubrerythrin  54.55 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  47.41 
 
 		 178 aa  124  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  49.62 
 
 		 168 aa  124  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  51.88 
 
 		 179 aa  124  9e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  48.55 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  48.55 
 
 		 178 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  49.62 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  53.03 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  50 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  51.91 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  45.99 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  50 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  51.13 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  47.83 
 
 		 190 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  49.61 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  50 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  46.62 
 
 		 178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  50.77 
 
 		 164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  44.83 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  45.07 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  46.9 
 
 		 191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  48.15 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  46.62 
 
 		 191 aa  111  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  44.6 
 
 		 191 aa  111  6e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  48.46 
 
 		 165 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  46.92 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  44.53 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  46.56 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  44.03 
 
 		 179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  48.46 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  44.53 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  42.65 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  41.89 
 
 		 196 aa  107  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  43.48 
 
 		 190 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  46.15 
 
 		 167 aa  107  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  47.66 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  47.29 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  47.41 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  43.8 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  43.8 
 
 		 191 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  45.11 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  47.01 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  47.73 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  44.6 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  41.43 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  44.53 
 
 		 191 aa  104  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  44.03 
 
 		 191 aa  104  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  43.7 
 
 		 191 aa  104  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  45.67 
 
 		 165 aa  104  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  46.97 
 
 		 166 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  44.78 
 
 		 188 aa  103  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  42.55 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  46.97 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  47.29 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  42.76 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  51.11 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  46.09 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  45.38 
 
 		 221 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  44.78 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  46.92 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  42.65 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  43.57 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  43.97 
 
 		 192 aa  101  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  44.62 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  45.04 
 
 		 164 aa  100  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>