214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0940 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  100 
 
 		 164 aa  339  1e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  88.96 
 
 		 164 aa  305  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  79.39 
 
 		 165 aa  259  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  74.53 
 
 		 167 aa  248  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  65.24 
 
 		 164 aa  224  5.0000000000000005e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  65.62 
 
 		 164 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  60.12 
 
 		 163 aa  191  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  61.73 
 
 		 168 aa  191  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  58.43 
 
 		 166 aa  186  9e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  57.23 
 
 		 166 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  59.88 
 
 		 168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  56.63 
 
 		 166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  57.76 
 
 		 168 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  56.02 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  56.79 
 
 		 172 aa  178  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  57.67 
 
 		 166 aa  177  4.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  55.76 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  61.35 
 
 		 169 aa  173  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  56.44 
 
 		 166 aa  173  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  55.56 
 
 		 168 aa  171  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  56.71 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  60.25 
 
 		 163 aa  169  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  55.83 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  54.6 
 
 		 165 aa  167  5e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  59.48 
 
 		 166 aa  166  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  59.48 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  55.28 
 
 		 164 aa  164  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  53.37 
 
 		 165 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  51.81 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  50.6 
 
 		 165 aa  162  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  53.99 
 
 		 166 aa  162  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  53.55 
 
 		 158 aa  158  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  49.4 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  50.31 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  49.4 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  50 
 
 		 166 aa  150  8e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  48.8 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  49.4 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  46.99 
 
 		 166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  46.63 
 
 		 166 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  46.63 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  47.24 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  46.63 
 
 		 166 aa  134  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  41.38 
 
 		 182 aa  128  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  46.25 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  45.06 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  42.69 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  43.21 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  43.1 
 
 		 182 aa  121  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  41.32 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  44.17 
 
 		 168 aa  118  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  44.85 
 
 		 170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  44.85 
 
 		 170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  42.24 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  45.22 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  41.21 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  49.61 
 
 		 140 aa  114  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  50.39 
 
 		 140 aa  112  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  41.72 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  42.07 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  48.06 
 
 		 146 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  49.62 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  38.64 
 
 		 185 aa  110  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  48.06 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  43.79 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  40.85 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  43.75 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  48.84 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  39.88 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  37.28 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  49.61 
 
 		 140 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  37.14 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  49.61 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  49.61 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  49.61 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  35.63 
 
 		 263 aa  104  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  36.21 
 
 		 228 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  47.29 
 
 		 168 aa  103  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  48.84 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  48.84 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  48.84 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  47.29 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  47.29 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  47.29 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  47.29 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  37.28 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  48.06 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  47.29 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  47.29 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  47.29 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  47.29 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  47.29 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  47.29 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  37.72 
 
 		 202 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  41.52 
 
 		 216 aa  101  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  36.36 
 
 		 184 aa  101  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  34.97 
 
 		 184 aa  101  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  39.39 
 
 		 392 aa  100  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  46.51 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  46.51 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>