197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1771 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  100 
 
 		 184 aa  383  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  75 
 
 		 184 aa  295  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  73.91 
 
 		 184 aa  290  6e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  58.79 
 
 		 185 aa  227  7e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  56.11 
 
 		 185 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  50.55 
 
 		 182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  51.69 
 
 		 182 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  51.69 
 
 		 167 aa  191  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  50.56 
 
 		 169 aa  185  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  49.44 
 
 		 182 aa  185  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  51.12 
 
 		 170 aa  185  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  51.12 
 
 		 170 aa  185  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  51.69 
 
 		 167 aa  181  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  50 
 
 		 170 aa  181  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  49.72 
 
 		 168 aa  179  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  46.7 
 
 		 169 aa  169  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  43.68 
 
 		 165 aa  150  8.999999999999999e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  42.53 
 
 		 165 aa  148  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  44.83 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  44.25 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  40.68 
 
 		 165 aa  144  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  36.93 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  40.57 
 
 		 165 aa  139  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  42.53 
 
 		 166 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  41.14 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  42.53 
 
 		 166 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  43.68 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  41.95 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  42.05 
 
 		 164 aa  136  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  40.57 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  42.44 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  40.8 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  41.95 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  43.11 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  40.8 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  44.12 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  43.11 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  40.91 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  40.23 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  38.29 
 
 		 166 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  37.14 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  43.02 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  37.29 
 
 		 166 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  43.45 
 
 		 168 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  38.01 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  38.98 
 
 		 166 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  43.71 
 
 		 166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  40.91 
 
 		 166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  38.98 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  38.98 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  41.48 
 
 		 168 aa  121  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  40.49 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  40.34 
 
 		 172 aa  117  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  40.22 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  35.12 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  35.59 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  41.48 
 
 		 182 aa  109  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  38.64 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  34.66 
 
 		 228 aa  104  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  35.23 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  37.08 
 
 		 164 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  36.36 
 
 		 164 aa  101  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  36.09 
 
 		 167 aa  99  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  34.76 
 
 		 191 aa  95.5  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  37.36 
 
 		 169 aa  95.5  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  34.29 
 
 		 167 aa  84.7  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  30.81 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  33.15 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  28.89 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  31.82 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  28.25 
 
 		 202 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  32.62 
 
 		 191 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  29.47 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  28.25 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  35.21 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.585668 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  35.86 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  30.98 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  30.98 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  30.98 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  32.39 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  34.62 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  34.24 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  33.15 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  30.51 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  31.89 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  31.82 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  30.85 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  31.02 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0398  Rubrerythrin  29.78 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  34.07 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  35.34 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  32.02 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  30.27 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  29.21 
 
 		 263 aa  75.1  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  30.29 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  31.22 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  31.11 
 
 		 216 aa  74.3  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  31.69 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  32.78 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  33.33 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>