195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2183 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  100 
 
 		 167 aa  342  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  43.29 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  43.9 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  44.58 
 
 		 165 aa  130  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  43.48 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  41.44 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  43.98 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  42.77 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  42.07 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  42.17 
 
 		 165 aa  124  9e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  43.29 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  42.59 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  43.03 
 
 		 165 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  40.36 
 
 		 173 aa  117  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  40.12 
 
 		 166 aa  117  9e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  40.61 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  41.61 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  41.1 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  37.13 
 
 		 166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  42.5 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  39.16 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  37.5 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  37.72 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  37.95 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  38.2 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  36.14 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  40.83 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  40.38 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  41.82 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  38.51 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  38.41 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  40.76 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  40 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  38.85 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  38.32 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  39.76 
 
 		 166 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  36.53 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  37.18 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  40.74 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  38.04 
 
 		 165 aa  101  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  37.64 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  37.58 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  39.78 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  38.89 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  37.5 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  33.13 
 
 		 169 aa  97.8  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  38.71 
 
 		 166 aa  97.8  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  34.64 
 
 		 228 aa  97.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  38.85 
 
 		 165 aa  97.4  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  39.16 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  33.53 
 
 		 167 aa  95.9  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  33.52 
 
 		 184 aa  95.5  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  33.33 
 
 		 263 aa  94.7  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  36.13 
 
 		 166 aa  94.4  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  33.53 
 
 		 170 aa  93.6  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  33.14 
 
 		 184 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  36.75 
 
 		 166 aa  91.7  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  34.29 
 
 		 184 aa  91.3  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  36.75 
 
 		 166 aa  91.3  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  33.94 
 
 		 169 aa  88.6  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  35.54 
 
 		 166 aa  88.2  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  37.5 
 
 		 169 aa  87.8  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  33.14 
 
 		 202 aa  87.8  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  31.58 
 
 		 170 aa  87.4  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  31.58 
 
 		 170 aa  87.4  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  32.56 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  32.73 
 
 		 202 aa  85.1  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  36.31 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  29.78 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  33.33 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  33.93 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  30.9 
 
 		 190 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  33.33 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  31.64 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  34.3 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  33.53 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  31.28 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0398  Rubrerythrin  33.14 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  30.27 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  34.3 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  34.3 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  33.9 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  33.13 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  29.73 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  32.77 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  28.24 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  28.24 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  30.94 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  33.12 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  30.53 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  30.19 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  31.61 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  30.82 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  31.1 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  30.56 
 
 		 191 aa  70.9  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  30.48 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  29.57 
 
 		 197 aa  70.9  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  31.28 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  37.5 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  37.88 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>