199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0418 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  100 
 
 
184 aa  386  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  73.91 
 
 
184 aa  290  6e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  66.85 
 
 
184 aa  259  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  58.24 
 
 
185 aa  228  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  53.3 
 
 
182 aa  209  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  56.59 
 
 
185 aa  207  7e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  54.44 
 
 
167 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  50.56 
 
 
169 aa  190  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  49.44 
 
 
170 aa  184  9e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  49.44 
 
 
170 aa  184  9e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  50.29 
 
 
182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  52.87 
 
 
168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  49.44 
 
 
170 aa  177  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  47.25 
 
 
169 aa  176  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  46.67 
 
 
167 aa  174  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  46.63 
 
 
182 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  47.65 
 
 
166 aa  150  8e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  42.35 
 
 
165 aa  148  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  42.94 
 
 
165 aa  149  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  44.12 
 
 
166 aa  145  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  37.91 
 
 
173 aa  143  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  43.53 
 
 
166 aa  141  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  42.94 
 
 
166 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  44.71 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  42.35 
 
 
166 aa  139  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  42.11 
 
 
165 aa  137  6e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  43.56 
 
 
166 aa  137  7.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  40 
 
 
166 aa  137  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  37.7 
 
 
166 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  45.4 
 
 
166 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  38.37 
 
 
166 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  41.38 
 
 
168 aa  135  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  38.46 
 
 
168 aa  135  5e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  42.11 
 
 
165 aa  134  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  38.1 
 
 
166 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  41.18 
 
 
166 aa  134  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  44.51 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  42.44 
 
 
165 aa  133  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  39.41 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  37.65 
 
 
166 aa  132  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  37.7 
 
 
166 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  43.64 
 
 
168 aa  131  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  38.95 
 
 
163 aa  131  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  41.57 
 
 
165 aa  127  7.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  39.77 
 
 
166 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  35.67 
 
 
158 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  39.43 
 
 
166 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  40.46 
 
 
172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  38.6 
 
 
166 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  38.6 
 
 
166 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  38.82 
 
 
168 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  39.26 
 
 
167 aa  122  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  36.21 
 
 
164 aa  121  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  43.11 
 
 
163 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  35.98 
 
 
166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  37.22 
 
 
184 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  39.44 
 
 
165 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  37.29 
 
 
228 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  42.05 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  36.2 
 
 
164 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  35.93 
 
 
164 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  34.97 
 
 
164 aa  101  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  34.5 
 
 
167 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  33.72 
 
 
169 aa  90.9  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  32.97 
 
 
183 aa  90.1  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  32.97 
 
 
183 aa  90.1  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  32.97 
 
 
183 aa  89.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  32.04 
 
 
216 aa  87  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  27.68 
 
 
202 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  27.68 
 
 
202 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0398  Rubrerythrin  31.46 
 
 
200 aa  85.1  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  30.65 
 
 
177 aa  85.1  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  32.42 
 
 
194 aa  85.1  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  31.35 
 
 
215 aa  85.1  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  30.37 
 
 
196 aa  84  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  34.62 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  30.14 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  31.67 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  29.55 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  28.65 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  29.63 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  27.75 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  30.11 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  31.32 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  26.55 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  30.81 
 
 
392 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  30.34 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  30.29 
 
 
191 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  30.81 
 
 
214 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  29.71 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  33.81 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  30.16 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  28.34 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  34.72 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  28.19 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  32.22 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  29.78 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0296  rubrerythrin  35.04 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.585668 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  30.16 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  31.07 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>