202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0274 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  100 
 
 		 170 aa  350  4e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  100 
 
 		 170 aa  350  4e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  81.18 
 
 		 170 aa  298  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  76.19 
 
 		 169 aa  268  2.9999999999999997e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  74.4 
 
 		 167 aa  254  3e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  67.66 
 
 		 169 aa  234  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  60.36 
 
 		 168 aa  201  5e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  57.14 
 
 		 167 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  52.17 
 
 		 185 aa  191  3e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  51.12 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  50 
 
 		 184 aa  184  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  49.44 
 
 		 184 aa  184  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  45.86 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  48.62 
 
 		 182 aa  167  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  44.75 
 
 		 185 aa  164  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  51.55 
 
 		 165 aa  160  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  51.52 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  50.93 
 
 		 166 aa  157  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  50.3 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  50.31 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  47.85 
 
 		 165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  46.67 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  47.47 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  46.06 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  46.2 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  38.89 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  47.2 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  48.15 
 
 		 168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  45.34 
 
 		 166 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  48.15 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  44.85 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  44.94 
 
 		 165 aa  135  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  40.96 
 
 		 173 aa  134  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  46.5 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  43.64 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  45.96 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  46.3 
 
 		 168 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  44.44 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  43.87 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  41.82 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  41.92 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  43.67 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  41.82 
 
 		 166 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  42.04 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  42.17 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  43.03 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  42.41 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  41.32 
 
 		 166 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  43.48 
 
 		 165 aa  127  8.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  41.03 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  46.95 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  40.36 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  47.56 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  37.65 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  43.48 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  44.85 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  39.26 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  42.33 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  38.27 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  39.63 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  44.1 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  32.94 
 
 		 184 aa  97.8  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  39.64 
 
 		 181 aa  94  9e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  32.78 
 
 		 228 aa  91.3  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  35.8 
 
 		 215 aa  90.1  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  34.86 
 
 		 183 aa  88.2  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  34.86 
 
 		 183 aa  88.2  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  34.86 
 
 		 183 aa  87.8  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  32.95 
 
 		 202 aa  87.8  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  38.32 
 
 		 177 aa  86.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  32.07 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  38.95 
 
 		 182 aa  85.9  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  33.72 
 
 		 233 aa  84.7  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  37.8 
 
 		 221 aa  84.7  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  31.64 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  36.94 
 
 		 392 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  31.58 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  35.33 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  33.54 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  35.93 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  33.33 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  33.33 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  37.2 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0398  Rubrerythrin  33.33 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  36.47 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  31.21 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2184  rubrerythrin  31.05 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  32.18 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  31.79 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  34.24 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  36.75 
 
 		 696 aa  74.3  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2617  Rubrerythrin  33.66 
 
 		 202 aa  73.9  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.919735  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  34.52 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  31.43 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1537  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  31.84 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0402296  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  32.75 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  35.47 
 
 		 696 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  29.6 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  31.1 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  29.73 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>