201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3563 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  100 
 
 		 182 aa  384  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  79.12 
 
 		 182 aa  308  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  52.81 
 
 		 185 aa  188  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  53.89 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  49.44 
 
 		 184 aa  185  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  49.44 
 
 		 182 aa  181  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  50.28 
 
 		 167 aa  174  8e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  48.31 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  46.63 
 
 		 184 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  46.67 
 
 		 169 aa  168  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  48.62 
 
 		 170 aa  167  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  48.62 
 
 		 170 aa  167  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  46.7 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  46.96 
 
 		 170 aa  162  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  45.86 
 
 		 167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  45.3 
 
 		 169 aa  160  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  43.5 
 
 		 166 aa  141  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  44.07 
 
 		 166 aa  141  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  44.94 
 
 		 165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  44.07 
 
 		 166 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  40.78 
 
 		 166 aa  137  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  43.75 
 
 		 166 aa  137  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  43.18 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  43.75 
 
 		 166 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  42.61 
 
 		 166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  44.07 
 
 		 163 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  43.82 
 
 		 165 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  45.83 
 
 		 166 aa  131  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  45.56 
 
 		 168 aa  130  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  43.43 
 
 		 168 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  39.33 
 
 		 173 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  45.03 
 
 		 164 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  43.79 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  43.2 
 
 		 166 aa  127  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  42.17 
 
 		 168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  43.1 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  45.71 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  42.6 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  44.97 
 
 		 164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  41.38 
 
 		 168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  42.29 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  41.14 
 
 		 165 aa  125  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  43.21 
 
 		 158 aa  124  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  43.68 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  44.91 
 
 		 166 aa  124  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  42.05 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  43.1 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  41.38 
 
 		 165 aa  121  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  41.32 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  39.08 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  39.66 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  40.12 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  39.08 
 
 		 166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  37.5 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  43.75 
 
 		 163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  37.36 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  40.24 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  36.11 
 
 		 166 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  36.78 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  39.55 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  35.56 
 
 		 166 aa  104  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  42.6 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  40.68 
 
 		 182 aa  101  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  37.64 
 
 		 167 aa  95.9  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  32.77 
 
 		 202 aa  94.4  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  34.64 
 
 		 202 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  32.77 
 
 		 228 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  32.2 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  32.2 
 
 		 263 aa  93.2  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  34.3 
 
 		 178 aa  89.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  35.16 
 
 		 196 aa  89  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  40 
 
 		 168 aa  87  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  36.05 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  39.26 
 
 		 139 aa  86.7  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  42.42 
 
 		 140 aa  85.1  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  36.05 
 
 		 191 aa  85.1  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  39.71 
 
 		 140 aa  85.1  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  40.74 
 
 		 140 aa  85.1  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  40 
 
 		 139 aa  84.7  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  37.5 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  40 
 
 		 140 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  40.88 
 
 		 140 aa  84  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  40.44 
 
 		 139 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  36.05 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  32.78 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  40 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  39.13 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  36.31 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  40 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  40 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  38.52 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  40.88 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  38.52 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  38.52 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  38.52 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  38.52 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  38.52 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  38.52 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  38.52 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  32.96 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>