216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3175 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  100 
 
 		 164 aa  340  7e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  88.96 
 
 		 164 aa  305  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  79.64 
 
 		 165 aa  259  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  73.29 
 
 		 167 aa  249  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  65.43 
 
 		 164 aa  223  7e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  67.07 
 
 		 164 aa  217  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  62.96 
 
 		 168 aa  202  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  61.96 
 
 		 168 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  59.63 
 
 		 168 aa  193  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  57.67 
 
 		 163 aa  188  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  55.69 
 
 		 166 aa  187  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  56.29 
 
 		 166 aa  186  8e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  56.29 
 
 		 166 aa  186  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  56.17 
 
 		 168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  56.17 
 
 		 172 aa  181  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  55.69 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  56.97 
 
 		 166 aa  177  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  57.32 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  62.5 
 
 		 163 aa  174  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  57.76 
 
 		 164 aa  173  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  61.11 
 
 		 169 aa  173  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  56.1 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  58.82 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  53.66 
 
 		 165 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  53.89 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  53.89 
 
 		 165 aa  170  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  53.01 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  55.21 
 
 		 165 aa  168  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  54.55 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  52.69 
 
 		 165 aa  167  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  55.62 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  53.29 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  52.1 
 
 		 166 aa  163  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  54.6 
 
 		 165 aa  163  9e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  51.5 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  50.92 
 
 		 165 aa  157  5e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  52.9 
 
 		 158 aa  157  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  50.9 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  47.9 
 
 		 166 aa  151  5e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  47.85 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  49.08 
 
 		 166 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  42.53 
 
 		 182 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  46.63 
 
 		 173 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  46.01 
 
 		 167 aa  137  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  45 
 
 		 167 aa  127  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  53.44 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  43.1 
 
 		 182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  42.69 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  41.25 
 
 		 167 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  43.21 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  44.1 
 
 		 170 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  41.24 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  44.17 
 
 		 168 aa  122  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  43.48 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  43.48 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  52.71 
 
 		 140 aa  120  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  43.59 
 
 		 168 aa  120  8e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  39.66 
 
 		 185 aa  118  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  39.75 
 
 		 169 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  51.94 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  42.31 
 
 		 182 aa  116  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  52.67 
 
 		 140 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  48.51 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  51.15 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  50.38 
 
 		 139 aa  114  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  50.77 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  51.54 
 
 		 140 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  51.15 
 
 		 140 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  51.15 
 
 		 140 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  51.15 
 
 		 140 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  42.5 
 
 		 166 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  50.38 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  37.87 
 
 		 184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  49.62 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  48.46 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  50.36 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  49.64 
 
 		 140 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  49.23 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  49.23 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  49.23 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  49.23 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  49.23 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  49.23 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  49.23 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  49.23 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  48.18 
 
 		 139 aa  110  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  37.14 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  48.85 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  50.38 
 
 		 139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  36.78 
 
 		 263 aa  109  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  43.29 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  41.76 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  36.2 
 
 		 184 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  50.38 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  50.38 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  35.63 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  42.14 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  42.42 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  48.09 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  48.87 
 
 		 139 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>