209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1646 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  100 
 
 		 165 aa  340  5e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  88.48 
 
 		 165 aa  301  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  72.12 
 
 		 166 aa  260  4.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  71.52 
 
 		 166 aa  254  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  70.91 
 
 		 166 aa  253  8e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  70.91 
 
 		 166 aa  251  3e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  67.88 
 
 		 166 aa  243  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  63.03 
 
 		 165 aa  223  8e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  58.79 
 
 		 166 aa  214  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  56.97 
 
 		 166 aa  211  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  56.97 
 
 		 166 aa  209  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  56.97 
 
 		 166 aa  209  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  54.55 
 
 		 164 aa  180  6e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  54.55 
 
 		 168 aa  179  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  56.44 
 
 		 164 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  53.37 
 
 		 166 aa  175  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  53.33 
 
 		 168 aa  174  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  53.33 
 
 		 168 aa  174  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  53.99 
 
 		 166 aa  174  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  50 
 
 		 166 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  55.09 
 
 		 165 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  50 
 
 		 166 aa  171  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  54.55 
 
 		 166 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  55.84 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  54.49 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  52.44 
 
 		 168 aa  168  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  53.05 
 
 		 172 aa  168  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  52.69 
 
 		 164 aa  167  6e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  51.53 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  49.38 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  49.4 
 
 		 165 aa  164  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  48.8 
 
 		 166 aa  164  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  48.78 
 
 		 165 aa  163  8e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  51.61 
 
 		 158 aa  161  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  50.91 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  48.39 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  46.34 
 
 		 165 aa  157  5e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  49.4 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  48.45 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  50.31 
 
 		 170 aa  155  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  50.31 
 
 		 170 aa  155  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  45.96 
 
 		 167 aa  154  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  47.59 
 
 		 163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  45.4 
 
 		 168 aa  150  7e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  43.68 
 
 		 184 aa  150  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  45.06 
 
 		 167 aa  150  8.999999999999999e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  44.25 
 
 		 184 aa  149  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  45.45 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  44.51 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  42.94 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  47.53 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  44.44 
 
 		 169 aa  147  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  51.83 
 
 		 163 aa  147  9e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  43.56 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  49.08 
 
 		 169 aa  143  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  47.74 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  47.34 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  42.6 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  43.48 
 
 		 166 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  42.6 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  42.6 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  43.59 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  42.95 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  43.59 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  41.4 
 
 		 233 aa  117  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  43.11 
 
 		 177 aa  114  7.999999999999999e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  39.63 
 
 		 228 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  40.49 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  48.46 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  39.26 
 
 		 178 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  40.85 
 
 		 392 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  38.36 
 
 		 179 aa  105  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  48.46 
 
 		 140 aa  105  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  46.92 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  48.46 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  48.03 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  47.69 
 
 		 146 aa  104  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  45.45 
 
 		 139 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  46.92 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  46.92 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  46.92 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  47.24 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  46.15 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  46.92 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  46.92 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  46.92 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  46.92 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  46.92 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  45.38 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  46.92 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  46.92 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  46.92 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  46.15 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  46.92 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  46.92 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  45.04 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  39.88 
 
 		 179 aa  101  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  46.92 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  39.26 
 
 		 178 aa  101  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  46.92 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>