199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_19080 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  100 
 
 
185 aa  383  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  62.64 
 
 
182 aa  240  7e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  58.24 
 
 
184 aa  228  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  58.79 
 
 
184 aa  227  7e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  53.85 
 
 
184 aa  203  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  55.14 
 
 
185 aa  192  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  52.25 
 
 
182 aa  190  9e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  53.07 
 
 
167 aa  189  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  52.81 
 
 
182 aa  188  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  50.28 
 
 
167 aa  181  7e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  47.78 
 
 
169 aa  181  7e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  45.9 
 
 
169 aa  169  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  49.72 
 
 
168 aa  166  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  44.75 
 
 
170 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  44.75 
 
 
170 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  44.2 
 
 
170 aa  154  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  44 
 
 
165 aa  148  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  40.8 
 
 
166 aa  147  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  42.7 
 
 
166 aa  144  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  44.07 
 
 
166 aa  143  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  43.68 
 
 
166 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  39.89 
 
 
173 aa  142  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  45.24 
 
 
166 aa  142  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  42.29 
 
 
165 aa  142  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  47.34 
 
 
165 aa  142  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  45.24 
 
 
166 aa  141  6e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  42.86 
 
 
165 aa  141  7e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  44 
 
 
163 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  44.38 
 
 
165 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  44.44 
 
 
168 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  41.81 
 
 
166 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  40.8 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  40.8 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  46.15 
 
 
166 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  44 
 
 
165 aa  139  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  42.13 
 
 
166 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  43.75 
 
 
164 aa  136  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  42.86 
 
 
165 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  38.76 
 
 
167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  38.29 
 
 
168 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  41.57 
 
 
166 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  38.76 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  39.89 
 
 
166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  39.89 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  42.26 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  38.6 
 
 
158 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  40.48 
 
 
166 aa  129  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  37.71 
 
 
166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  43.6 
 
 
164 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  40.56 
 
 
172 aa  125  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  41.71 
 
 
168 aa  125  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  38.86 
 
 
184 aa  124  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  39.44 
 
 
168 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  42.94 
 
 
165 aa  121  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  38.42 
 
 
164 aa  120  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  41.67 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  39.66 
 
 
164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  41.81 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  37.02 
 
 
168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  38.64 
 
 
164 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  34.27 
 
 
228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  41.71 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  108  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  37.64 
 
 
167 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  34.97 
 
 
183 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  34.97 
 
 
183 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  34.97 
 
 
183 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  36.56 
 
 
192 aa  100  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  33.7 
 
 
216 aa  99.8  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  35.87 
 
 
191 aa  98.6  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  32.61 
 
 
215 aa  99  4e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  35.68 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  30.51 
 
 
202 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  33.69 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  33.51 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  34.05 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  33.69 
 
 
197 aa  96.3  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  36.76 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  33.7 
 
 
194 aa  94.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  39.34 
 
 
169 aa  94.4  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  35.33 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0398  Rubrerythrin  32.77 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  29.38 
 
 
202 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  34.78 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  41.91 
 
 
140 aa  92.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  32.61 
 
 
194 aa  92.8  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  35.14 
 
 
190 aa  92  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  35.68 
 
 
190 aa  91.7  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  33.69 
 
 
192 aa  91.7  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  35.68 
 
 
191 aa  90.5  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  32.24 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  32.42 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  32.61 
 
 
194 aa  89.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  32.97 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  39.1 
 
 
144 aa  89.4  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  41.18 
 
 
140 aa  89.4  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  40.71 
 
 
140 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  40.71 
 
 
140 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  40.71 
 
 
140 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  32.42 
 
 
177 aa  89.4  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>