205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1571 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  100 
 
 		 166 aa  340  5e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  89.7 
 
 		 166 aa  306  5.9999999999999995e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  81.93 
 
 		 166 aa  291  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  66.87 
 
 		 166 aa  232  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  65.06 
 
 		 166 aa  222  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  66.06 
 
 		 166 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  59.04 
 
 		 166 aa  214  5.9999999999999996e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  56.97 
 
 		 166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  58.64 
 
 		 165 aa  194  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  58.02 
 
 		 165 aa  192  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  56.79 
 
 		 165 aa  191  5e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  56.1 
 
 		 168 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  52.47 
 
 		 166 aa  187  7e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  53.94 
 
 		 166 aa  184  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  53.33 
 
 		 166 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  54.22 
 
 		 173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  53.33 
 
 		 166 aa  181  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  51.52 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  53.89 
 
 		 165 aa  174  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  59.64 
 
 		 163 aa  174  7e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  52.8 
 
 		 168 aa  173  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  54.66 
 
 		 168 aa  173  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  51.81 
 
 		 167 aa  173  9e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  56.44 
 
 		 164 aa  173  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  57.69 
 
 		 164 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  50 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  53.42 
 
 		 168 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  53.33 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  50 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  54.55 
 
 		 164 aa  169  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  51.85 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  50.91 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  50.6 
 
 		 163 aa  166  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  50.3 
 
 		 166 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  51.52 
 
 		 166 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  47.83 
 
 		 167 aa  157  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  49.38 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  52.73 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  49.67 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  50.3 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  51.83 
 
 		 167 aa  155  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  50.3 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  46.01 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  46.3 
 
 		 168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  45.45 
 
 		 166 aa  150  8e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  48.78 
 
 		 165 aa  150  8.999999999999999e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  49.08 
 
 		 172 aa  149  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  46.67 
 
 		 170 aa  147  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  45.45 
 
 		 169 aa  147  9e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  43.83 
 
 		 166 aa  144  6e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  44.25 
 
 		 182 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  44.79 
 
 		 169 aa  143  9e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  42.13 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  47.2 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  45.4 
 
 		 184 aa  137  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  43.75 
 
 		 182 aa  134  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  39.66 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  43.18 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  41.24 
 
 		 184 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  49.39 
 
 		 169 aa  130  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  43.71 
 
 		 184 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  38.76 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  39.16 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  41.62 
 
 		 228 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  40.96 
 
 		 177 aa  107  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  39.26 
 
 		 392 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  44.62 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  38.18 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  39.29 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  38.18 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  36.14 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  42.42 
 
 		 146 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  41.34 
 
 		 182 aa  101  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  36.69 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  34.34 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  34.34 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  37.72 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0268  rubrerythrin  45.38 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  45.38 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  36.81 
 
 		 221 aa  98.6  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0538  rubrerythrin  45.38 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  39.16 
 
 		 179 aa  98.6  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  43.08 
 
 		 140 aa  98.6  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  43.18 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1448  rubrerythrin  45.38 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732112  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1645  rubrerythrin  45.38 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.500908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  45.38 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  45.38 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  45.38 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  43.08 
 
 		 168 aa  97.8  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  36.14 
 
 		 180 aa  97.4  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  33.94 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  45.38 
 
 		 140 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  45.38 
 
 		 140 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  43.85 
 
 		 140 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  37.14 
 
 		 202 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  43.85 
 
 		 139 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  43.85 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  43.85 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  43.85 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>