197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0583 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  100 
 
 
166 aa  345  2e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  81.93 
 
 
166 aa  295  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  81.33 
 
 
166 aa  291  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  78.31 
 
 
166 aa  282  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  78.31 
 
 
166 aa  280  5.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  72.73 
 
 
165 aa  257  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  70.91 
 
 
165 aa  253  8e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  67.27 
 
 
165 aa  237  5e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  57.23 
 
 
166 aa  199  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  56.02 
 
 
166 aa  198  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  56.02 
 
 
166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  54.22 
 
 
166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  51.52 
 
 
166 aa  169  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  52.73 
 
 
164 aa  167  6e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  47.27 
 
 
166 aa  157  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  50.6 
 
 
168 aa  157  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  49.4 
 
 
165 aa  157  7e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  47.88 
 
 
166 aa  156  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  47.59 
 
 
166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  46.34 
 
 
166 aa  152  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  47.27 
 
 
168 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  47.27 
 
 
168 aa  152  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  47.59 
 
 
166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  47.9 
 
 
164 aa  151  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  47.65 
 
 
184 aa  150  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  46.95 
 
 
165 aa  150  7e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  45.45 
 
 
166 aa  150  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  48.86 
 
 
185 aa  150  8e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  46.63 
 
 
166 aa  150  8.999999999999999e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  46.95 
 
 
165 aa  149  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  50.61 
 
 
172 aa  149  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  48.72 
 
 
158 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  47.7 
 
 
184 aa  148  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  49.07 
 
 
167 aa  147  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  47.9 
 
 
164 aa  148  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  48.5 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  44.83 
 
 
184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  48.78 
 
 
168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  48.12 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  46.99 
 
 
164 aa  144  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  43.03 
 
 
167 aa  143  9e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  45.12 
 
 
166 aa  143  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  45.24 
 
 
185 aa  142  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  47.53 
 
 
164 aa  142  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  45.12 
 
 
165 aa  142  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  45.4 
 
 
173 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  43.21 
 
 
167 aa  135  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  47.44 
 
 
167 aa  134  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  44.23 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  44.31 
 
 
182 aa  131  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  43.45 
 
 
163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  43.03 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  41.72 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  43.03 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  43.2 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  42.29 
 
 
182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  48.7 
 
 
163 aa  125  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  42.95 
 
 
166 aa  125  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  44.79 
 
 
169 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  41.92 
 
 
182 aa  124  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  39.88 
 
 
169 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  39.29 
 
 
228 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  38.69 
 
 
184 aa  114  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  42.68 
 
 
178 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  42.68 
 
 
178 aa  111  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  37.87 
 
 
233 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  38.22 
 
 
178 aa  104  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  40.13 
 
 
177 aa  102  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  39.41 
 
 
179 aa  102  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  39.53 
 
 
179 aa  101  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  41.67 
 
 
202 aa  101  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  39.74 
 
 
178 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  39.87 
 
 
179 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  39.87 
 
 
179 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  38.92 
 
 
179 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  44.36 
 
 
140 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  39.16 
 
 
216 aa  99.8  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  40.25 
 
 
179 aa  99.4  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  39.41 
 
 
190 aa  99  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  37.04 
 
 
179 aa  98.2  5e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  39.74 
 
 
221 aa  98.2  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  44.62 
 
 
140 aa  97.1  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  45.38 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  40.48 
 
 
202 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  36.46 
 
 
194 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  43.08 
 
 
168 aa  95.5  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  45.38 
 
 
140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  38.1 
 
 
202 aa  95.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  36.46 
 
 
194 aa  95.1  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  45.38 
 
 
140 aa  94.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  45.38 
 
 
140 aa  94.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  43.85 
 
 
146 aa  94.4  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  45.38 
 
 
140 aa  94.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  39.52 
 
 
392 aa  94.4  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  36.31 
 
 
263 aa  94.4  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  38.12 
 
 
182 aa  94  9e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  46.15 
 
 
140 aa  94  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  44.7 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  39.87 
 
 
179 aa  93.2  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  45.38 
 
 
140 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>