207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2197 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  100 
 
 		 166 aa  342  2e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  84.34 
 
 		 166 aa  300  7.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  81.93 
 
 		 166 aa  295  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  84.34 
 
 		 166 aa  294  3e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  78.31 
 
 		 166 aa  282  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  75.76 
 
 		 165 aa  271  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  72.12 
 
 		 165 aa  260  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  71.52 
 
 		 165 aa  250  8.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  59.04 
 
 		 166 aa  216  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  59.04 
 
 		 166 aa  211  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  59.64 
 
 		 166 aa  211  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  59.04 
 
 		 166 aa  208  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  56.36 
 
 		 164 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  52.73 
 
 		 166 aa  177  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  52.73 
 
 		 166 aa  173  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  54.6 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  53.33 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  51.52 
 
 		 168 aa  165  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  50.3 
 
 		 168 aa  164  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  54.27 
 
 		 172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  50.6 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  49.09 
 
 		 166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  50.6 
 
 		 166 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  52.1 
 
 		 164 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  51.81 
 
 		 165 aa  160  8.000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  50 
 
 		 166 aa  160  9e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  51.5 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  50 
 
 		 168 aa  158  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  49.69 
 
 		 165 aa  157  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  48.17 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  53.29 
 
 		 165 aa  156  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  50.31 
 
 		 173 aa  156  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  52.26 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  48.17 
 
 		 167 aa  154  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  48.45 
 
 		 165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  49.39 
 
 		 168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  50.91 
 
 		 167 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  47.85 
 
 		 167 aa  151  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  45.4 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  49.4 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  46.34 
 
 		 168 aa  148  4e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  47.5 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  44.25 
 
 		 184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  44.12 
 
 		 184 aa  145  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  45.34 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  46.06 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  53.9 
 
 		 163 aa  141  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  44.07 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  45.24 
 
 		 185 aa  141  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  46.06 
 
 		 170 aa  141  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  46.06 
 
 		 170 aa  141  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  49.38 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  44.58 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  41.72 
 
 		 167 aa  136  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  41.46 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  43.12 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  42.01 
 
 		 182 aa  131  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  45.83 
 
 		 182 aa  131  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  47.85 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  40.48 
 
 		 182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  39.02 
 
 		 169 aa  124  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  41.46 
 
 		 228 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  42.04 
 
 		 233 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  41.67 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  44.23 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  43.59 
 
 		 178 aa  110  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  42.07 
 
 		 216 aa  106  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  39.88 
 
 		 221 aa  105  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  42.95 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  36.63 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  41.14 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  40.49 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  40.59 
 
 		 190 aa  100  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  41.67 
 
 		 179 aa  100  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  43.04 
 
 		 179 aa  100  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  45.74 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  40.49 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  40.24 
 
 		 392 aa  99.8  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  45.74 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  36.81 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  36.81 
 
 		 194 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0138  Rubrerythrin  38.69 
 
 		 263 aa  99  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.996422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2089  Rubrerythrin  38.1 
 
 		 202 aa  99  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  41.21 
 
 		 179 aa  98.2  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  40.76 
 
 		 167 aa  97.4  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  46.88 
 
 		 140 aa  97.4  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  36.36 
 
 		 179 aa  97.1  9e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  45.74 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  35.71 
 
 		 194 aa  96.7  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  41.44 
 
 		 182 aa  95.9  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3337  nigerythrin  38.1 
 
 		 202 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  47.29 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  47.29 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  38.69 
 
 		 202 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  45.67 
 
 		 140 aa  95.9  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  45.74 
 
 		 140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  47.29 
 
 		 140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0358727 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  45.74 
 
 		 140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2491  putative rubrerythrin  45.74 
 
 		 140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  45.74 
 
 		 140 aa  95.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>