60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1596 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1596  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  252  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2434  rubrerythrin  71.77 
 
 
124 aa  181  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0387  rubrerythrin  50.41 
 
 
139 aa  110  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.424409 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1532  rubrerythrin  50 
 
 
139 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0458  rubrerythrin  49.59 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.79007  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0449  rubrerythrin  50 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2476  rubrerythrin  45 
 
 
140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000982174  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15600  Rubrerythrin  46.67 
 
 
141 aa  99  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1879  rubrerythrin  45.16 
 
 
140 aa  94.4  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000143668  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0954  rubrerythrin  46.34 
 
 
140 aa  94.4  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1108  Rubrerythrin  44.17 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.666656  normal  0.376082 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4567  Rubrerythrin  43.44 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.02567e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3816  rubrerythrin  40.68 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0588  rubrerythrin  40.98 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0081  rubrerythrin  39.5 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2955  rubredoxin/rubrerythrin  40.98 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00806345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0099  rubrerythrin  40.98 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0220347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2638  rubrerythrin  40.98 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0077  rubredoxin/rubrerythrin  40.98 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.165154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3505  rubrerythrin  41.32 
 
 
180 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000134331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0682  rubredoxin/rubrerythrin  41.18 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0681  rubredoxin/rubrerythrin  41.18 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0902  Rubrerythrin  41.8 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197939  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  37.72 
 
 
166 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  32.56 
 
 
139 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  42.11 
 
 
166 aa  50.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  35.65 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  42.47 
 
 
168 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  42.47 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  38.96 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  36.04 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  42.67 
 
 
165 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  37.66 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  30.23 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  30.23 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  38.79 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  30.23 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  36.97 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  32.14 
 
 
184 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  31.86 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  42.67 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  39.47 
 
 
166 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  35.04 
 
 
185 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  39.02 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  41.33 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  40 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  28.93 
 
 
233 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  35.4 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  35.62 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  37.14 
 
 
167 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  39.47 
 
 
166 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3322  bacterioferritin  27.21 
 
 
159 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.636204  normal  0.0746797 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  38.16 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  38.67 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0899  Rubrerythrin  31.3 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  29.01 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  36 
 
 
166 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  41.1 
 
 
163 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  33.05 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  33.08 
 
 
165 aa  40  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>