87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3816 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3816  rubrerythrin  100 
 
 		 180 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4567  Rubrerythrin  67.96 
 
 		 181 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.02567e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0681  rubredoxin/rubrerythrin  67.22 
 
 		 180 aa  250  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0682  rubredoxin/rubrerythrin  67.22 
 
 		 180 aa  249  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0588  rubrerythrin  65.75 
 
 		 181 aa  249  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0077  rubredoxin/rubrerythrin  66.11 
 
 		 180 aa  248  5e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.165154  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2638  rubrerythrin  66.11 
 
 		 188 aa  247  7e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0099  rubrerythrin  66.11 
 
 		 180 aa  247  8e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0220347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2955  rubredoxin/rubrerythrin  66.11 
 
 		 180 aa  247  8e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00806345  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0081  rubrerythrin  65.92 
 
 		 181 aa  244  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0902  Rubrerythrin  68.51 
 
 		 181 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197939  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3505  rubrerythrin  62.22 
 
 		 180 aa  231  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000134331  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1879  rubrerythrin  53.33 
 
 		 140 aa  123  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000143668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0954  rubrerythrin  46.72 
 
 		 140 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15600  Rubrerythrin  45.14 
 
 		 141 aa  110  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2476  rubrerythrin  45.39 
 
 		 140 aa  110  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000982174  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0387  rubrerythrin  43.66 
 
 		 139 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.424409 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0449  rubrerythrin  43.66 
 
 		 139 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0458  rubrerythrin  42.34 
 
 		 139 aa  107  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.79007  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1532  rubrerythrin  42.25 
 
 		 139 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1108  Rubrerythrin  43.57 
 
 		 143 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.666656  normal  0.376082 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2434  rubrerythrin  41.46 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1596  hypothetical protein  40.68 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  32.08 
 
 		 392 aa  58.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  29.57 
 
 		 696 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  27.96 
 
 		 696 aa  55.8  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  27.93 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2117  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  63.64 
 
 		 111 aa  53.9  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1529  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.88 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00138894  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  47.22 
 
 		 520 aa  52.4  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3241  hypothetical protein  55.88 
 
 		 36 aa  52  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000312443  hitchhiker  0.0015976 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  60 
 
 		 216 aa  51.2  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0063  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.41 
 
 		 111 aa  51.2  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  30.51 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  31.01 
 
 		 192 aa  48.1  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  75 
 
 		 172 aa  47.8  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  28.87 
 
 		 196 aa  47.8  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2460  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase or nitrite reductase  40.74 
 
 		 501 aa  47.8  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000440664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  32.56 
 
 		 190 aa  47.8  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  53.33 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  50 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  29.37 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  29.37 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  29.37 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  28.57 
 
 		 139 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  30.51 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  29.06 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  29.06 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  30.97 
 
 		 166 aa  45.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  46.67 
 
 		 884 aa  45.1  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2234  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.39 
 
 		 221 aa  44.7  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000004842  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  29.37 
 
 		 196 aa  44.7  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  46.88 
 
 		 183 aa  44.3  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  46.88 
 
 		 183 aa  44.3  0.0009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  46.88 
 
 		 183 aa  44.3  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  28.57 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  37.88 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  57.58 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  65.52 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  46.88 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  30.51 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  28.91 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  50 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  54.17 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  27.34 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  70 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  29.69 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  35.14 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  65.22 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  33.78 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  58.33 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  62.07 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  39.19 
 
 		 166 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  58.33 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  23.78 
 
 		 194 aa  42  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  37.5 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  51.72 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  28.57 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  48.48 
 
 		 878 aa  41.6  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  48.48 
 
 		 878 aa  41.6  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  30.51 
 
 		 178 aa  41.2  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  32.43 
 
 		 166 aa  41.2  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  39.19 
 
 		 166 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  29.75 
 
 		 139 aa  41.2  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  29.69 
 
 		 191 aa  41.2  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  27.64 
 
 		 140 aa  41.2  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  25.95 
 
 		 191 aa  41.2  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>